148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2017 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2017  MltA  100 
 
 		 440 aa  859    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3831  MltA domain-containing protein  67.14 
 
 		 412 aa  482  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.328531  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  57.7 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  45.56 
 
 		 405 aa  259  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  44.19 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  41.26 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  39.23 
 
 		 421 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  38.42 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  37.85 
 
 		 396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  47.86 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  43.24 
 
 		 418 aa  230  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  41.78 
 
 		 341 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  40.3 
 
 		 401 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  41.51 
 
 		 341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  43.7 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  41.78 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  40.8 
 
 		 405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  39.3 
 
 		 341 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2733  transglycosylase, putative  44.56 
 
 		 412 aa  219  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.927679  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  40.59 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  41.99 
 
 		 475 aa  216  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  35.81 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  39.47 
 
 		 338 aa  212  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.12 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.12 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.12 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.12 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.12 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  43.69 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.12 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  41.76 
 
 		 396 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  42.38 
 
 		 433 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40.8 
 
 		 374 aa  209  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  40.63 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  48.12 
 
 		 384 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  42.11 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  38.73 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.31 
 
 		 543 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  40.8 
 
 		 410 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  40.23 
 
 		 410 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  37.69 
 
 		 352 aa  202  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  35.87 
 
 		 386 aa  201  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  39.94 
 
 		 409 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  38.08 
 
 		 386 aa  201  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  39.94 
 
 		 410 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  39.94 
 
 		 374 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0295  MltA domain protein  42.4 
 
 		 381 aa  199  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.64 
 
 		 502 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  37.72 
 
 		 375 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  36.97 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  39.39 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  36.44 
 
 		 380 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  39.42 
 
 		 410 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  37.24 
 
 		 383 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  37.18 
 
 		 542 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  37.13 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  36.31 
 
 		 500 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.84 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  41.26 
 
 		 403 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  37.7 
 
 		 402 aa  193  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  38.01 
 
 		 374 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  39.02 
 
 		 369 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  38.44 
 
 		 492 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  39.14 
 
 		 368 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  38.63 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  38.73 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  36.09 
 
 		 383 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  40.91 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0139  MltA domain-containing protein  34.78 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  42.5 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.86 
 
 		 506 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  40.91 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  38.41 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  36.92 
 
 		 497 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  42.6 
 
 		 514 aa  183  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  37.66 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  34.8 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  38.33 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  34.95 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  39.1 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  35.21 
 
 		 354 aa  170  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  39.05 
 
 		 372 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  40.43 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  39.42 
 
 		 372 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  40.43 
 
 		 395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0606  MltA domain protein  39.02 
 
 		 358 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.964162  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3217  MltA domain-containing protein  36.69 
 
 		 372 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1840  MltA domain protein  37.11 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  39.72 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1561  MltA domain-containing protein  36.96 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4085  MltA domain-containing protein  36.1 
 
 		 395 aa  156  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000353348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1680  MltA domain protein  36.78 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3714  MltA domain-containing protein  36.67 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.551112 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.27 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  35.44 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1254  murein transglycosylase A  30.11 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000109222  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1398  MltA domain protein  33.81 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1368  MltA domain protein  33.81 
 
 		 389 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5039  MltA domain-containing protein  36.73 
 
 		 381 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.258863 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>