156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4651 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4651  MltA  100 
 
 
422 aa  846    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.139284  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3893  MltA domain-containing protein  81.44 
 
 
414 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.304798 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  62.85 
 
 
433 aa  472  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  63.95 
 
 
382 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  68.88 
 
 
380 aa  461  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  68.88 
 
 
402 aa  464  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  60.52 
 
 
435 aa  461  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  62.05 
 
 
456 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0843  MltA domain-containing protein  58.59 
 
 
416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  51.94 
 
 
397 aa  322  7e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  45.48 
 
 
431 aa  317  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  42.31 
 
 
382 aa  252  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  42.33 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  40.49 
 
 
375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  42.61 
 
 
410 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  42.03 
 
 
374 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  43.1 
 
 
393 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  44.98 
 
 
380 aa  237  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.82 
 
 
374 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  43.65 
 
 
374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  38.03 
 
 
410 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  41.16 
 
 
410 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  43.83 
 
 
384 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  43.52 
 
 
380 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  40.87 
 
 
409 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  41.74 
 
 
410 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  41.16 
 
 
410 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40.17 
 
 
425 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40.17 
 
 
425 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40.17 
 
 
425 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40.17 
 
 
425 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40.17 
 
 
382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40.17 
 
 
372 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40.29 
 
 
400 aa  223  7e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  38.83 
 
 
410 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  38.83 
 
 
374 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  40.41 
 
 
433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  36.17 
 
 
405 aa  212  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  37.1 
 
 
397 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  36.01 
 
 
383 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  38.92 
 
 
418 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  36.01 
 
 
392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  36.01 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  36.97 
 
 
385 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  39.44 
 
 
342 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  35.46 
 
 
383 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  36.41 
 
 
386 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  36.1 
 
 
399 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  37.07 
 
 
352 aa  189  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  36.66 
 
 
403 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  35.25 
 
 
402 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  40.19 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  38.87 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  33.58 
 
 
421 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.27 
 
 
543 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  28.04 
 
 
386 aa  180  4e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  35.65 
 
 
386 aa  180  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  35.2 
 
 
542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  32.28 
 
 
398 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  37.05 
 
 
368 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  42.74 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  34.51 
 
 
396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  30.67 
 
 
500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  42.34 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  30.93 
 
 
502 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  32.3 
 
 
362 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  32.02 
 
 
369 aa  161  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  31.89 
 
 
475 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.97 
 
 
506 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  33.33 
 
 
365 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.08 
 
 
381 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  31.67 
 
 
514 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  32.52 
 
 
492 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  32.15 
 
 
497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  33.11 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  32.09 
 
 
372 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  29.24 
 
 
356 aa  145  9e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  31.44 
 
 
382 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1840  MltA domain protein  32.68 
 
 
418 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1561  MltA domain-containing protein  32.68 
 
 
387 aa  143  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  36.03 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3714  MltA domain-containing protein  31.85 
 
 
398 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.551112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3217  MltA domain-containing protein  32.17 
 
 
372 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1680  MltA domain protein  31.56 
 
 
383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  36.56 
 
 
401 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  32.46 
 
 
413 aa  133  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  33.67 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  34.89 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4085  MltA domain-containing protein  35.43 
 
 
395 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000353348  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0520  3D domain protein  27.1 
 
 
534 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  34.18 
 
 
412 aa  130  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  34.1 
 
 
354 aa  129  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0999  MltA domain protein  35.48 
 
 
407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  29.54 
 
 
398 aa  126  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0639  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  52.63 
 
 
134 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229529  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  29.18 
 
 
396 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  35.4 
 
 
351 aa  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1358  MltA domain protein  32.31 
 
 
386 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0295  MltA domain protein  33.94 
 
 
381 aa  123  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1368  MltA domain protein  33.72 
 
 
389 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>