146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4651 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  100 
 
 
433 aa  857    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  77.86 
 
 
402 aa  621  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  77.63 
 
 
380 aa  586  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  73.98 
 
 
435 aa  586  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0843  MltA domain-containing protein  68.92 
 
 
416 aa  566  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  60.47 
 
 
456 aa  495  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3893  MltA domain-containing protein  66.67 
 
 
414 aa  480  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.304798 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4651  MltA  67.74 
 
 
422 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.139284  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  63.93 
 
 
382 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  50.12 
 
 
431 aa  364  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  54.93 
 
 
397 aa  345  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  40.51 
 
 
375 aa  258  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  45.56 
 
 
410 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  44.41 
 
 
374 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  44.13 
 
 
374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  44.7 
 
 
410 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  45.22 
 
 
382 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  39.75 
 
 
376 aa  251  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  44.41 
 
 
409 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  44.7 
 
 
410 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  44.7 
 
 
374 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  40.48 
 
 
410 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  44.99 
 
 
410 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  43.91 
 
 
393 aa  246  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  44.7 
 
 
410 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40.19 
 
 
425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40.19 
 
 
425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40.19 
 
 
425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40.19 
 
 
425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.64 
 
 
382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.64 
 
 
372 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  44.79 
 
 
380 aa  242  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  42.3 
 
 
380 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  43.35 
 
 
433 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  44.79 
 
 
374 aa  239  5.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  42.58 
 
 
384 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  37.74 
 
 
405 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40 
 
 
400 aa  226  8e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  37.06 
 
 
397 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  40.97 
 
 
418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  37.6 
 
 
383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  36.54 
 
 
392 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  37.5 
 
 
398 aa  204  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  37.29 
 
 
385 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  36.26 
 
 
392 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  36.77 
 
 
383 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  38.44 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  37.36 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  37.68 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.66 
 
 
543 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  30.38 
 
 
386 aa  199  6e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  37.75 
 
 
403 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  35.11 
 
 
500 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  35.38 
 
 
402 aa  193  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  35.81 
 
 
542 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  40.25 
 
 
341 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.94 
 
 
342 aa  187  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.12 
 
 
502 aa  187  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  36.24 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  34.71 
 
 
421 aa  180  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  40.92 
 
 
341 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  40.92 
 
 
341 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  35.58 
 
 
475 aa  176  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.47 
 
 
506 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  37.77 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  34.22 
 
 
382 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  33.98 
 
 
362 aa  171  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  35.28 
 
 
497 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  33.24 
 
 
369 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  36.45 
 
 
338 aa  167  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  34.84 
 
 
492 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  33.88 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  35.54 
 
 
405 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  29.5 
 
 
356 aa  160  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  32.24 
 
 
416 aa  156  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  34.55 
 
 
372 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.71 
 
 
381 aa  156  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  34.96 
 
 
413 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0295  MltA domain protein  38.38 
 
 
381 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  36.91 
 
 
351 aa  154  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  33.33 
 
 
365 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3217  MltA domain-containing protein  34.97 
 
 
372 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3714  MltA domain-containing protein  37.46 
 
 
398 aa  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.551112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0520  3D domain protein  29.93 
 
 
534 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  28.31 
 
 
398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  28.04 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  33.51 
 
 
514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  32.79 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1840  MltA domain protein  33.61 
 
 
418 aa  146  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1561  MltA domain-containing protein  33.61 
 
 
387 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1358  MltA domain protein  33.66 
 
 
386 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  32.3 
 
 
354 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  39.08 
 
 
401 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  35.56 
 
 
412 aa  141  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  27.61 
 
 
404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0139  MltA domain-containing protein  33.95 
 
 
400 aa  136  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0639  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  58.78 
 
 
134 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229529  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  37.23 
 
 
384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1680  MltA domain protein  31.96 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1375  MltA domain-containing protein  34.71 
 
 
404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.164926  normal  0.128771 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>