147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3704 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  100 
 
 
405 aa  821    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  55.5 
 
 
418 aa  418  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  54.05 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  58.26 
 
 
400 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  54.19 
 
 
421 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  48.06 
 
 
382 aa  342  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  48.87 
 
 
393 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  47.98 
 
 
410 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  46.44 
 
 
374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  46.7 
 
 
374 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  49.29 
 
 
425 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  49.29 
 
 
425 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  49.29 
 
 
425 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  49.29 
 
 
425 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  47.85 
 
 
382 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  47.85 
 
 
372 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  47.69 
 
 
374 aa  322  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  46.67 
 
 
410 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  47.07 
 
 
410 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  48.72 
 
 
433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  46.07 
 
 
410 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  46.07 
 
 
374 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  46.4 
 
 
409 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  46.15 
 
 
380 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  46.15 
 
 
380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  45.33 
 
 
384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  46.34 
 
 
410 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  47.14 
 
 
383 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  46.49 
 
 
410 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  49.26 
 
 
386 aa  308  8e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  47.71 
 
 
383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  47.71 
 
 
392 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  47.14 
 
 
392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  42.08 
 
 
375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  41.09 
 
 
386 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  44.12 
 
 
376 aa  295  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  45.08 
 
 
399 aa  292  7e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  44.89 
 
 
386 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  45.07 
 
 
403 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  45.43 
 
 
402 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  44.03 
 
 
385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  41.58 
 
 
475 aa  272  8.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  39.12 
 
 
404 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0520  3D domain protein  36.84 
 
 
534 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  37.03 
 
 
398 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  37.03 
 
 
396 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3831  MltA domain-containing protein  44.67 
 
 
412 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.328531  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.58 
 
 
397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  36.66 
 
 
431 aa  249  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.48 
 
 
342 aa  247  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2017  MltA  45.23 
 
 
440 aa  245  9e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  41.11 
 
 
542 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  40.39 
 
 
405 aa  242  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  41.45 
 
 
338 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.89 
 
 
543 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  41.82 
 
 
356 aa  238  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  37.96 
 
 
398 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.33 
 
 
502 aa  228  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  37.22 
 
 
500 aa  227  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  39.84 
 
 
341 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  39.26 
 
 
352 aa  226  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  37.44 
 
 
433 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  37.62 
 
 
435 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  41.34 
 
 
506 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  42.94 
 
 
341 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  37.04 
 
 
416 aa  222  9e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  39.5 
 
 
402 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  39.5 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  41.11 
 
 
492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  42.94 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  44.03 
 
 
399 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  39.55 
 
 
396 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  45.42 
 
 
395 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  45.42 
 
 
395 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  36.54 
 
 
368 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  46.15 
 
 
514 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0139  MltA domain-containing protein  35.64 
 
 
400 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  39.24 
 
 
354 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0843  MltA domain-containing protein  35.97 
 
 
416 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  43.27 
 
 
405 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  36.14 
 
 
456 aa  209  9e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4651  MltA  39.09 
 
 
422 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.139284  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  37.88 
 
 
497 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  40 
 
 
407 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  37.33 
 
 
413 aa  204  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  44.53 
 
 
401 aa  200  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  35.63 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0295  MltA domain protein  43.28 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  41.38 
 
 
412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  35.56 
 
 
362 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  36.29 
 
 
382 aa  196  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  35.56 
 
 
369 aa  196  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3893  MltA domain-containing protein  36.83 
 
 
414 aa  196  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.304798 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0639  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  69.4 
 
 
134 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229529  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  43.56 
 
 
384 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2733  transglycosylase, putative  39.62 
 
 
412 aa  186  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.927679  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  35.54 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  35.01 
 
 
372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  34.28 
 
 
372 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1840  MltA domain protein  39.16 
 
 
418 aa  179  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  0.508898 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>