145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0306 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  100 
 
 		 497 aa  1005    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  71.88 
 
 		 506 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  76.9 
 
 		 492 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  60.08 
 
 		 542 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  71.03 
 
 		 543 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  58.93 
 
 		 502 aa  578  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  69.52 
 
 		 500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  52.42 
 
 		 396 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  42.42 
 
 		 368 aa  266  8e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  42.7 
 
 		 362 aa  259  8e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  42.7 
 
 		 369 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  42.86 
 
 		 365 aa  249  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  37.03 
 
 		 398 aa  246  6.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  36.49 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  40.98 
 
 		 475 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  40.72 
 
 		 381 aa  240  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  39.78 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0999  MltA domain protein  42.89 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1680  MltA domain protein  41.08 
 
 		 383 aa  233  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  38.76 
 
 		 372 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1840  MltA domain protein  41.02 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1561  MltA domain-containing protein  40.75 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3217  MltA domain-containing protein  40.78 
 
 		 372 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1375  MltA domain-containing protein  41.16 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.164926  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  39.35 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.68 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  38.84 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  38.52 
 
 		 354 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3714  MltA domain-containing protein  42.76 
 
 		 398 aa  223  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.551112 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  35.89 
 
 		 386 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  41.11 
 
 		 400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  37.88 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  35.21 
 
 		 397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  37.14 
 
 		 341 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  37.46 
 
 		 341 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  35.95 
 
 		 410 aa  207  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  37.26 
 
 		 398 aa  206  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  37.25 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  35.95 
 
 		 374 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  37.18 
 
 		 341 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  35.41 
 
 		 410 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  35.31 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  38.61 
 
 		 386 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  40.26 
 
 		 351 aa  203  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  35.14 
 
 		 409 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  38.31 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  36.83 
 
 		 352 aa  201  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.68 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  35.68 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.5 
 
 		 374 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  33.42 
 
 		 425 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  33.42 
 
 		 425 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  33.42 
 
 		 425 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  33.42 
 
 		 425 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  33.42 
 
 		 382 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  33.96 
 
 		 374 aa  193  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  33.42 
 
 		 372 aa  193  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  34.14 
 
 		 410 aa  193  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  36.63 
 
 		 356 aa  193  7e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  33.15 
 
 		 433 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  35.29 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  34.63 
 
 		 418 aa  190  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.47 
 
 		 397 aa  189  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  35 
 
 		 382 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  35.6 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  33.24 
 
 		 393 aa  187  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2017  MltA  37.14 
 
 		 440 aa  186  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129045 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  37.78 
 
 		 407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3831  MltA domain-containing protein  35.28 
 
 		 412 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.328531  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  34.34 
 
 		 386 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  35.39 
 
 		 433 aa  183  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  34.08 
 
 		 402 aa  183  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  33.7 
 
 		 374 aa  183  8.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  33.85 
 
 		 431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  34.4 
 
 		 421 aa  181  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  35.16 
 
 		 392 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  35.16 
 
 		 383 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  35.16 
 
 		 392 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.92 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0139  MltA domain-containing protein  34.29 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  37.21 
 
 		 514 aa  177  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  38.71 
 
 		 416 aa  176  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  40.77 
 
 		 405 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  32.89 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  39.71 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0843  MltA domain-containing protein  33.96 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  32.7 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  32.87 
 
 		 375 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  38.76 
 
 		 412 aa  173  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  39.92 
 
 		 395 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  33.06 
 
 		 456 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  32.01 
 
 		 376 aa  173  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  33.07 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  32.16 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  38.78 
 
 		 395 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  32.16 
 
 		 380 aa  169  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  32.33 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  33.25 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  31.02 
 
 		 380 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4651  MltA  32.15 
 
 		 422 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.139284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>