147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0420 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  67.38 
 
 		 502 aa  641    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  82.96 
 
 		 506 aa  746    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  67.85 
 
 		 542 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  100 
 
 		 492 aa  1004    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  66.81 
 
 		 500 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  68.44 
 
 		 497 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  65.42 
 
 		 543 aa  632  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  52.51 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  43.58 
 
 		 368 aa  279  7e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  41.27 
 
 		 362 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  41.27 
 
 		 369 aa  266  8e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  38.76 
 
 		 372 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  39.89 
 
 		 372 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  36.49 
 
 		 398 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  35.95 
 
 		 396 aa  242  9e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  39.89 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  40.06 
 
 		 365 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  38.42 
 
 		 397 aa  240  5e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0999  MltA domain protein  42.96 
 
 		 407 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.39 
 
 		 381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  41.11 
 
 		 405 aa  234  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  39.78 
 
 		 382 aa  234  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3217  MltA domain-containing protein  40.5 
 
 		 372 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  38.03 
 
 		 382 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  39.08 
 
 		 410 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  38.54 
 
 		 410 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  39.08 
 
 		 374 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  37.47 
 
 		 410 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  37.64 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  38.54 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  38.27 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.47 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  37.99 
 
 		 405 aa  225  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3714  MltA domain-containing protein  42.91 
 
 		 398 aa  223  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.551112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.54 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  38.34 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40.22 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  36.66 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1375  MltA domain-containing protein  42.62 
 
 		 404 aa  221  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.164926  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  37.53 
 
 		 386 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1840  MltA domain protein  40.58 
 
 		 418 aa  220  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1680  MltA domain protein  39.89 
 
 		 383 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  37.57 
 
 		 354 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1561  MltA domain-containing protein  40.32 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.84 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.66 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.66 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  36.93 
 
 		 433 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.66 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.66 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.66 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.66 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  36.77 
 
 		 385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  37.78 
 
 		 352 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  35.34 
 
 		 386 aa  213  5.999999999999999e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  37.71 
 
 		 418 aa  213  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  37.29 
 
 		 338 aa  213  9e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  41.53 
 
 		 351 aa  211  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  37.39 
 
 		 341 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  35.26 
 
 		 380 aa  204  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.52 
 
 		 342 aa  204  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  36.66 
 
 		 398 aa  203  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  37.22 
 
 		 341 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  35.16 
 
 		 384 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  36.93 
 
 		 341 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  35.75 
 
 		 374 aa  200  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.03 
 
 		 397 aa  199  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  34.54 
 
 		 380 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3831  MltA domain-containing protein  37.79 
 
 		 412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.328531  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  38.07 
 
 		 407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  34.38 
 
 		 376 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  36.29 
 
 		 421 aa  196  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  33.24 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2017  MltA  37.86 
 
 		 440 aa  194  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  35.91 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  34.4 
 
 		 383 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  37.14 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  33.78 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  34.79 
 
 		 403 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  34.72 
 
 		 402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  34.95 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  34.15 
 
 		 382 aa  180  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  35.01 
 
 		 383 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  41.09 
 
 		 405 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  34.31 
 
 		 399 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  34.17 
 
 		 392 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  40.81 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  33.33 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  33.7 
 
 		 392 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  40.07 
 
 		 395 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  40.07 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  38.13 
 
 		 514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  32.35 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  40.07 
 
 		 384 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0843  MltA domain-containing protein  35.11 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.46 
 
 		 399 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  36.86 
 
 		 412 aa  171  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  32.7 
 
 		 402 aa  170  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0139  MltA domain-containing protein  31.87 
 
 		 400 aa  170  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  32.7 
 
 		 380 aa  169  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>