More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0040 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0040  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
206 aa  392  1e-108  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0101018 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1083  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  68.66 
 
 
205 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.175416  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0043  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  60.11 
 
 
196 aa  217  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31536  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2139  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  60.71 
 
 
197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0846  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.24 
 
 
192 aa  101  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1185  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.1 
 
 
213 aa  101  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34 
 
 
207 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.18 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0082  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.48 
 
 
197 aa  95.9  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33 
 
 
213 aa  95.1  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  29.5 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.5 
 
 
206 aa  92.8  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  30 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  30 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  30 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  30 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  30 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  30 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29 
 
 
206 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  30 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  30 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.37 
 
 
215 aa  91.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29 
 
 
206 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.36 
 
 
211 aa  91.7  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29 
 
 
206 aa  91.3  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29 
 
 
206 aa  91.3  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  33.33 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.33 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.72 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8100  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.71 
 
 
203 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  33 
 
 
239 aa  89  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29 
 
 
206 aa  88.6  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3099  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.41 
 
 
209 aa  88.2  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.554479  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1743  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565671  normal  0.375082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.44 
 
 
225 aa  87  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  31.31 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.84 
 
 
207 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  28.86 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.92 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.92 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  30.15 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.65 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0954  integral membrane protein, MarC family  30.29 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.789644  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.18 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  31.31 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  32.32 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.67 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.98 
 
 
203 aa  85.5  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.37 
 
 
216 aa  85.1  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 
206 aa  85.1  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  23.83 
 
 
198 aa  85.1  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.3 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.88 
 
 
211 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0268  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.86 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  26.94 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1164  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.02 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0901375  normal  0.311138 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.82 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1449  MarC membrane protein  27.92 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000727679  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  29.21 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.07 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  29.21 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  30.81 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.79 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.2 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.51 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  36.36 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  32.06 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3071  MCP methyltransferase, CheR-type  27.88 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.574672  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  28.71 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.44 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.65 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  29.28 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.06 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.16 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  31.05 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  27.72 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2873  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0372  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.39 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2518  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.24 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135192  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1228  membrane transporter, MarC family  28.93 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.83 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.54 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5060  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.5 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  30.37 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  27.64 
 
 
203 aa  79  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.33 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193827  hitchhiker  0.0000682503 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2908  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein protein  33.16 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.275757  normal  0.0232741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  29.35 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  30.53 
 
 
210 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.5 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.15 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  28.92 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2476  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.51 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>