More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2139 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_2139  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
197 aa  367  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0043  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  65.26 
 
 
196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31536  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0040  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  60.71 
 
 
206 aa  222  4e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0101018 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1083  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  57.75 
 
 
205 aa  213  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.175416  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1185  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.17 
 
 
213 aa  98.6  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1449  MarC membrane protein  30.85 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000727679  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1251  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.95 
 
 
203 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000866197  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1228  membrane transporter, MarC family  29.95 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  30.39 
 
 
239 aa  86.3  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28 
 
 
207 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.72 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.53 
 
 
218 aa  85.5  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  31.53 
 
 
216 aa  85.5  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.57 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.27 
 
 
217 aa  85.1  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.88 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.4 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.67 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.67 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0846  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.44 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.72 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.88 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  29.5 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.54 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.21 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0082  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.65 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.35 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  29.35 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.15 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.32 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.27 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.95 
 
 
217 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.06 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.57 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  27.86 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  27.86 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  27.86 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  27.86 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  27.59 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.86 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  27.86 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.67 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  27.86 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  27.86 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  27.55 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  27.86 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.35 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  25.13 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.64 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.36 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.32 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2476  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.98 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  25 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  29.32 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.86 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0603  multiple antibiotic resistance MarC-related protein  29.95 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.36 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.36 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  25 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  25 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  29.08 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.86 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  25 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  25 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  25 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  25 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  25 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  29.32 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.86 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  27.04 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.12 
 
 
229 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.9732  normal  0.188603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3245  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.9 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  24.35 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.45 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.94 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3711  multiple antibiotic resistance protein  27.37 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.372343  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.67 
 
 
219 aa  72  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.67 
 
 
210 aa  72  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  25.81 
 
 
194 aa  72  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  28.42 
 
 
217 aa  72  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0188  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.47 
 
 
197 aa  72  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5060  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.54 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2645  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.7 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.86 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.08 
 
 
216 aa  71.2  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.72 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  30.88 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2825  integral membrane protein, MarC family  26.04 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  32.81 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  24.74 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.666037 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1602  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.23 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0931799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8100  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.21 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  24.23 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.4 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0372  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.7 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  30.21 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.15 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.66 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>