More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2978 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 212 aa  420  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3316  multiple antibiotic resistance protein  70.64 
 
 		 219 aa  307  6.999999999999999e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229288 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  58.77 
 
 		 220 aa  252  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  57.89 
 
 		 213 aa  248  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  51.89 
 
 		 207 aa  221  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  49.76 
 
 		 208 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.02 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.04 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  45.05 
 
 		 203 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0155  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.58 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1407  hypothetical protein  38.61 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0713518  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.63 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.45 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  37.74 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.96 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.96 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.42 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.42 
 
 		 213 aa  121  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  34.11 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  34.47 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.82 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2046  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.67 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  36.95 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5328  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.71 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193827  hitchhiker  0.0000682503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  33.99 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.16 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  35.27 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  35.27 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  33.98 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  34.78 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  35.27 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  35.27 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  35.27 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  35.27 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  34.78 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  35.27 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  34.16 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  34.65 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  32.52 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  35.85 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.2 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10401  hypothetical protein  35.12 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  33.81 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.1 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  32.52 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  35.68 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.47 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.75 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.65 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.06 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  32.84 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3071  MCP methyltransferase, CheR-type  32.04 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.574672  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  35.27 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.98 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.2 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.39 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6025  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.81 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0264079 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  32.85 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0374  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.55 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.774303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  33.51 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  33.51 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  33.51 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  33.51 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  33.51 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  36.15 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  34.83 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  34.83 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  30.73 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.66 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  34.83 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  34.83 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  34.83 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  32.65 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3711  multiple antibiotic resistance protein  31.84 
 
 		 212 aa  101  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.372343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1394  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.31 
 
 		 236 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.31 
 
 		 236 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.45 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.84 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2671  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.38 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4013  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.36 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.648921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.66 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  33.66 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  32.14 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.79 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.66 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.4 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.84 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  34.33 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2141  multiple drug resistance protein MarC  33.5 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0214276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.85 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.58 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  31.58 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.67 
 
 		 202 aa  99.8  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  33.65 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1802  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.18 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0240208  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1791  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.64 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>