More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27780 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  100 
 
 
203 aa  397  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  77.56 
 
 
210 aa  271  6e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2908  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein protein  72.5 
 
 
206 aa  270  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.275757  normal  0.0232741 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  64.9 
 
 
211 aa  249  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2479  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  62.69 
 
 
206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1164  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  65.33 
 
 
201 aa  218  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0901375  normal  0.311138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8100  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  57.71 
 
 
203 aa  204  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0736  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  56.57 
 
 
204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.588775  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0682  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  55.28 
 
 
204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7403  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4608  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  55.38 
 
 
201 aa  167  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.170336  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  49.25 
 
 
203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.729209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8398  MarC membrane protein  48.21 
 
 
203 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.504083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1877  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50.75 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06600  conserved hypothetical protein TIGR00427  48.76 
 
 
206 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.99 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.32 
 
 
207 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  35 
 
 
206 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35 
 
 
206 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.16 
 
 
202 aa  121  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0856  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.18 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.66496  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.45 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.49 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  36.1 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40 
 
 
219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0374  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.47 
 
 
214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.774303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.76 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.11 
 
 
203 aa  118  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  35.18 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.87 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.54 
 
 
206 aa  116  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  33.82 
 
 
212 aa  114  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.43 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.82 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.35 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.17 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  32.34 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  32.34 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  32.34 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.44 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.03 
 
 
208 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  32.84 
 
 
210 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.95 
 
 
213 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  32.84 
 
 
210 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  32.84 
 
 
210 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  32.84 
 
 
210 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  37.06 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  31.84 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  34.95 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  31.84 
 
 
210 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  37.06 
 
 
209 aa  111  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  34.67 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3099  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.82 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.554479  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.95 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.61 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  33.33 
 
 
206 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  33.33 
 
 
206 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  33.33 
 
 
206 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  33.33 
 
 
206 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  33.33 
 
 
206 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  33.33 
 
 
206 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 
213 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  32.2 
 
 
214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  32.18 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  32.84 
 
 
215 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  32.84 
 
 
215 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  32.04 
 
 
214 aa  108  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.18 
 
 
206 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  32.84 
 
 
215 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  32.84 
 
 
215 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  32.84 
 
 
215 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0693  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.66 
 
 
209 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  31.66 
 
 
215 aa  108  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  32.35 
 
 
215 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  32.35 
 
 
215 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  35.5 
 
 
212 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  32.51 
 
 
215 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.51 
 
 
215 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  32.51 
 
 
215 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.34 
 
 
206 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2825  integral membrane protein, MarC family  31.94 
 
 
207 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  32.51 
 
 
215 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  32.51 
 
 
215 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  32.51 
 
 
215 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  32.51 
 
 
215 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.34 
 
 
206 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.34 
 
 
206 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.68 
 
 
212 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  31.19 
 
 
212 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  31.55 
 
 
214 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  33.67 
 
 
213 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  32.32 
 
 
210 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  31.55 
 
 
214 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0268  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.82 
 
 
206 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.85 
 
 
206 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.93 
 
 
217 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  32.04 
 
 
214 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.68 
 
 
206 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>