More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1083 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1083  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
205 aa  390  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.175416  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0040  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  68.66 
 
 
206 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0101018 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0043  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  59.04 
 
 
196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31536  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2139  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  57.75 
 
 
197 aa  203  1e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0846  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.52 
 
 
192 aa  99  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.46 
 
 
217 aa  94.7  9e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.64 
 
 
217 aa  94  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.27 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.61 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.05 
 
 
197 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  30.65 
 
 
209 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.77 
 
 
205 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  29.9 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  31.68 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.9 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  30.93 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.88 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.63 
 
 
209 aa  85.5  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3071  MCP methyltransferase, CheR-type  30.5 
 
 
207 aa  85.1  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.574672  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.92 
 
 
207 aa  85.1  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.5 
 
 
213 aa  84.7  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  28.14 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1185  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.52 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1449  MarC membrane protein  30 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000727679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0603  multiple antibiotic resistance MarC-related protein  31.44 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.84 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.85 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.64 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0268  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.05 
 
 
197 aa  82  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.08 
 
 
197 aa  82  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  29.57 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.65 
 
 
215 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.87 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.57 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  28.57 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.57 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.57 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.64 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.57 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.35 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.7 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.57 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.57 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.57 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  30.1 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8100  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.72 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  32.31 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  27.27 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  28 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.32 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  23.12 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3099  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.03 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.554479  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1228  membrane transporter, MarC family  30.53 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  23.12 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  30.46 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  29.02 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  24.12 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  24.12 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  24.12 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  24.12 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0082  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.95 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  24.12 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.85 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.73 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  24.12 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0092  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.27 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  24.12 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  25.63 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  24.12 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  30.37 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  25.63 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  29.57 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.35 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.86 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  24.12 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2476  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.57 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  30.77 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2825  integral membrane protein, MarC family  29.95 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  30.37 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  30.37 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  30.41 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  25.76 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  24.26 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.32 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.68 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.13 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  25.73 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.73 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.24 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  30.65 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  25.63 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  28.64 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002135  multiple antibiotic resistance protein marC  30.41 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0045  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.84 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  25.13 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3626  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.72 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>