More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8100 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8100  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  61.43 
 
 		 211 aa  248  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  57.71 
 
 		 203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2908  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein protein  61.08 
 
 		 206 aa  218  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.275757  normal  0.0232741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1164  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  66.33 
 
 		 201 aa  208  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0901375  normal  0.311138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  60.98 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8398  MarC membrane protein  58.91 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.504083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2479  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  58.17 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  58 
 
 		 203 aa  188  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.729209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4608  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  59.07 
 
 		 201 aa  187  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.170336  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06600  conserved hypothetical protein TIGR00427  58.91 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0736  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.77 
 
 		 204 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.588775  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0682  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  56.5 
 
 		 204 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7403  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1877  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.71 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0856  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  51.02 
 
 		 199 aa  144  9e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.66496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.47 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.47 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  35.61 
 
 		 206 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  35.61 
 
 		 206 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  35.61 
 
 		 206 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  35.61 
 
 		 206 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  35.61 
 
 		 206 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  35.61 
 
 		 206 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  35.61 
 
 		 206 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  35.61 
 
 		 206 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.95 
 
 		 206 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.95 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.86 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.47 
 
 		 206 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.47 
 
 		 206 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  34.16 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.47 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.97 
 
 		 207 aa  127  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.65 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  36.82 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.46 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  36.82 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.47 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.15 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.65 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.16 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  35.21 
 
 		 209 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  31.66 
 
 		 207 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.69 
 
 		 213 aa  121  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1743  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.98 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565671  normal  0.375082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.15 
 
 		 205 aa  121  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.67 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.31 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.84 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3245  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.5 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  33.66 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.66 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.86 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  31.22 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.86 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.15 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.78 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.05 
 
 		 212 aa  115  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.85 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.04 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  31.31 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.57 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.02 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.08 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  28.78 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  34.74 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.16 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  31.86 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.57 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  36.41 
 
 		 210 aa  111  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  28.78 
 
 		 214 aa  111  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  28.78 
 
 		 214 aa  111  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  28.29 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  31.4 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.9 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0374  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.13 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.774303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  27.32 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  27.32 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  27.45 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.45 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  27.45 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  27.45 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  27.45 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  27.45 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  27.45 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  28.08 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.02 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  32.29 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  29.56 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.63 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  31 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  32.12 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1763  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.06 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.619286  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  31.77 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  30.88 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.58 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  34.02 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>