More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0736 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0736  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 204 aa  384  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.588775  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0682  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  95.02 
 
 		 204 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7403  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  56.28 
 
 		 203 aa  211  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  57.35 
 
 		 211 aa  208  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4608  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  65.15 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.170336  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2908  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein protein  59.2 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.275757  normal  0.0232741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1164  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  60.41 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0901375  normal  0.311138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  60.7 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8100  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.77 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2479  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  56.72 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  55.05 
 
 		 203 aa  169  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.729209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1877  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  55.88 
 
 		 206 aa  167  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8398  MarC membrane protein  52.53 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.504083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06600  conserved hypothetical protein TIGR00427  54.27 
 
 		 206 aa  151  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.78 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0856  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.22 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.66496  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.82 
 
 		 205 aa  121  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  36.55 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  36.55 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.18 
 
 		 219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.55 
 
 		 203 aa  118  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.79 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  33.66 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  34 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  35.27 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.36 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.37 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.29 
 
 		 204 aa  111  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  34.65 
 
 		 212 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.27 
 
 		 217 aa  111  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.19 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.31 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0374  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.13 
 
 		 214 aa  108  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.774303 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.41 
 
 		 214 aa  107  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  30.92 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  30.92 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  30.92 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  30.92 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.8 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  29.95 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  29.95 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.11 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.51 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  29.95 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  29.95 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3099  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.64 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.554479  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  29.95 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  36.04 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.33 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.01 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.64 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1743  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.53 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565671  normal  0.375082 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  30.35 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2825  integral membrane protein, MarC family  35.11 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  29.9 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  29.7 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.7 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.81 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1802  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.38 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0240208  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  29.7 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  29.7 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  29.7 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  29.7 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  29.7 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  29.7 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.38 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.16 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174302  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  29.7 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  32.46 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  35.05 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.02 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  28.28 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00158  multiple antibiotic transporter  35.11 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  31.34 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.33 
 
 		 213 aa  98.6  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0268  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.17 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  29.29 
 
 		 210 aa  98.6  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  30.69 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.69 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.05 
 
 		 207 aa  97.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.51 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.05 
 
 		 198 aa  98.2  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0955  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.41 
 
 		 205 aa  97.8  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  28.04 
 
 		 215 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  27.59 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  29.41 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  28.04 
 
 		 215 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.18 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  28.04 
 
 		 215 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.05 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  28.04 
 
 		 215 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  28.04 
 
 		 215 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  29.9 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.18 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2046  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.18 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.51 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.98 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.31 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.51 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>