More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1684 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  407  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  99.52 
 
 		 210 aa  407  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  407  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  98.57 
 
 		 210 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  97.62 
 
 		 210 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  95.71 
 
 		 210 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  95.71 
 
 		 210 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  95.71 
 
 		 210 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  95.71 
 
 		 210 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  88.94 
 
 		 213 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  87.56 
 
 		 210 aa  367  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  88.73 
 
 		 207 aa  360  9e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  86.54 
 
 		 212 aa  353  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  88.46 
 
 		 210 aa  348  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  83.98 
 
 		 207 aa  343  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  77.88 
 
 		 210 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  52.15 
 
 		 215 aa  235  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.15 
 
 		 215 aa  235  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  52.15 
 
 		 215 aa  235  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  52.15 
 
 		 215 aa  235  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  52.15 
 
 		 215 aa  235  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  52.15 
 
 		 215 aa  235  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  52.15 
 
 		 215 aa  235  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  52.15 
 
 		 215 aa  235  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  52.66 
 
 		 215 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  50.96 
 
 		 214 aa  232  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  54.33 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  50.96 
 
 		 214 aa  231  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  50.96 
 
 		 214 aa  231  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  51.44 
 
 		 214 aa  230  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  54.59 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  50.72 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  50.72 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  50.72 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  50.72 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  50.72 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  50.72 
 
 		 215 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  50.48 
 
 		 214 aa  224  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  45.85 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  52.66 
 
 		 212 aa  208  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  41.09 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  41.09 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  41.09 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  41.09 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  41.09 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  41.09 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  41.09 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  41.09 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.11 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.12 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  38.12 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.62 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.62 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  41.67 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.13 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.13 
 
 		 206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.62 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.86 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.63 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3245  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  42.65 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.13 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.19 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  38.57 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.94 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.71 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  39.71 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.19 
 
 		 206 aa  151  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.88 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.86 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.86 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.05 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.42 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.64 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.89 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  34.13 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.32 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.29 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0372  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.54 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.35 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.65 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.42 
 
 		 213 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.76 
 
 		 217 aa  128  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.63 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5328  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.93 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.37 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.37 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 		 207 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.09 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.95 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3711  multiple antibiotic resistance protein  34.21 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.372343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  33.98 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.98 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.25 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.77 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.41 
 
 		 203 aa  118  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  34.04 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.83 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  35.38 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.16 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.38 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>