More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06600  conserved hypothetical protein TIGR00427  100 
 
 		 206 aa  391  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.08 
 
 		 211 aa  201  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1877  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  66.18 
 
 		 206 aa  201  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8100  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  58.91 
 
 		 203 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2908  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein protein  56.31 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.275757  normal  0.0232741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  48.76 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2479  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  55.88 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4608  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  58.55 
 
 		 201 aa  168  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.170336  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1164  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  57 
 
 		 201 aa  167  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0901375  normal  0.311138 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  55.28 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.729209 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0736  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.77 
 
 		 204 aa  152  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.588775  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8398  MarC membrane protein  51.02 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.504083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0682  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  55 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7403  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0856  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.97 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.66496  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.13 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.16 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.68 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.21 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  30.29 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  30.29 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.29 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  30.14 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  30.29 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  30.29 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  30.29 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  30.29 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  30.14 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.21 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.41 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  33.5 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.14 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  34.98 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.95 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  34.98 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.01 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  30.19 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.47 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  30.66 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.19 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  30.05 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  30.05 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  30.05 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  30.05 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  34.29 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  28.99 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.12 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.47 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.02 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  29.56 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  31.19 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.69 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  29.19 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  29.19 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  29.19 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  29.19 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.94 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  29.19 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  31.03 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  31.03 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  31.03 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  31.03 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.03 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.69 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  32.67 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  32.67 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  32.67 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  32.67 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.65 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  32.67 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  32.67 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.69 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  29.72 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  32.67 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  32.67 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  35.79 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.2 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.69 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.69 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.79 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  30.21 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  31.71 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  32.68 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  27.75 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.33 
 
 		 207 aa  98.2  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.2 
 
 		 204 aa  97.8  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  28.17 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  28.17 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  35.26 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.82 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.69 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  32.52 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.02 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  37.02 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  31.55 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  34.18 
 
 		 217 aa  95.5  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.2 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  28.02 
 
 		 214 aa  95.1  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  27.7 
 
 		 214 aa  94.7  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>