More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0856 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0856  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 199 aa  366  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.66496  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8100  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  51.02 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.96 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  45.18 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  52.58 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.729209 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1164  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.73 
 
 		 201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0901375  normal  0.311138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4608  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.42 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.170336  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  40.82 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2908  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein protein  47.15 
 
 		 206 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.275757  normal  0.0232741 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0736  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.22 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.588775  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.61 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1877  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50.77 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0682  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.97 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7403  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2479  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.23 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06600  conserved hypothetical protein TIGR00427  49.22 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.56 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.37 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  39.8 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8398  MarC membrane protein  46.19 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.504083 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.69 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  39.8 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.12 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.39 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.68 
 
 		 202 aa  121  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.73 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1802  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.92 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0240208  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.77 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.93 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.8 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.75 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  38.73 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.73 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.1 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.8 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.5 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  34.87 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  39.49 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.54 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.36 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.68 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.31 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  31.71 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1763  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.42 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.619286  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.55 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.31 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.44 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.13 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0693  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.57 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  38.24 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.54 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.65 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.69 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  40.61 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.15 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.66 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  32.65 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  32.65 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  32.65 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  32.65 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  32.65 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.62 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  32.65 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  32.65 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0272  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.16 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  34.72 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  32.65 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  34.33 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  32.16 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  31.41 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.83 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.19 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.82 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  34.24 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  34.33 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  30.29 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.29 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  30.29 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.1 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0372  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.85 
 
 		 215 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  30.3 
 
 		 215 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  30.3 
 
 		 215 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  30.29 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  34.24 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.14 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  30.29 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  33.84 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  30.29 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.51 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  30.3 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  30.29 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.83 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.51 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.83 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  33.33 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3316  multiple antibiotic resistance protein  32.02 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229288 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.79 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3245  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.5 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>