More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1795 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 
203 aa  384  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.729209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  55.67 
 
 
211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  49.25 
 
 
203 aa  189  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8100  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  58 
 
 
203 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1164  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  59 
 
 
201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0901375  normal  0.311138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2908  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein protein  55.72 
 
 
206 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.275757  normal  0.0232741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2479  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  55.5 
 
 
206 aa  164  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.5 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0736  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  55.05 
 
 
204 aa  162  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.588775  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4608  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.17 
 
 
201 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.170336  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0682  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  57.87 
 
 
204 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7403  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1877  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.5 
 
 
206 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06600  conserved hypothetical protein TIGR00427  55.28 
 
 
206 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8398  MarC membrane protein  55.72 
 
 
203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.504083 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0856  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.58 
 
 
199 aa  143  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.66496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  38.89 
 
 
206 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.89 
 
 
206 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.05 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.71 
 
 
206 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.12 
 
 
206 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.12 
 
 
206 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.12 
 
 
206 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.12 
 
 
206 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.23 
 
 
207 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.2 
 
 
206 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.2 
 
 
206 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.86 
 
 
207 aa  121  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  35.23 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  34.69 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  34.69 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  34.69 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  34.69 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  34.69 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  34.69 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  34.69 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  34.69 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.85 
 
 
213 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.27 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.22 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  37.13 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.13 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  35.89 
 
 
209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.18 
 
 
211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  32.64 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  31.22 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.88 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.22 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  31.22 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  32.64 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  31.22 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.39 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  31.22 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  35.55 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  32.64 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  31.22 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  32.64 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  31.22 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  32.68 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  32.64 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.14 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  30.05 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  30.05 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  30.05 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  31.53 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  30.05 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  32.12 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  31.53 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  32.12 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  30.05 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  32.12 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.34 
 
 
219 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  34.34 
 
 
212 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  32.12 
 
 
210 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.18 
 
 
207 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.41 
 
 
214 aa  112  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  33.67 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.03 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.8 
 
 
212 aa  111  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.66 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.72 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  39.38 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3245  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.47 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  34.78 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  28.57 
 
 
215 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  30.35 
 
 
213 aa  109  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.31 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  30.81 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  33.16 
 
 
210 aa  108  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  30.85 
 
 
212 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  29.06 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36 
 
 
218 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  36 
 
 
216 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  30.73 
 
 
197 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.54 
 
 
205 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  29.27 
 
 
214 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.79 
 
 
212 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.79 
 
 
212 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  30.73 
 
 
197 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.99 
 
 
208 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  28.35 
 
 
208 aa  105  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>