More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1802 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1802  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 		 207 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0240208  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1763  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  86.47 
 
 		 207 aa  316  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.619286  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.02 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  47.55 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1743  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.51 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565671  normal  0.375082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.76 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  46.77 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  45.32 
 
 		 205 aa  158  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  50 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  46.77 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.67 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  45.73 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  45.73 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.77 
 
 		 209 aa  154  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0955  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  48.04 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.33 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.12 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.9 
 
 		 214 aa  147  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.14 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2518  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  42.51 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135192  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0374  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  42.16 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.774303 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1719  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.27 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.82 
 
 		 210 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  38.83 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.07 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2873  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.93 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.5 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3099  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.71 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.554479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.43 
 
 		 219 aa  121  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2825  integral membrane protein, MarC family  34.63 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0693  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.46 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.31 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.666037 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  35.15 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.44 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.55 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.75 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.31 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2079  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.1 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00616176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.41 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000442646  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  33.99 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.27 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3071  MCP methyltransferase, CheR-type  33 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.574672  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.22 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.5 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00158  multiple antibiotic transporter  33 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.16 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.84 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.67 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.32 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  33.5 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.68 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.71 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  32.55 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.18 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.52 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2046  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.99 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.63 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.63 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  35.18 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  30.88 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.17 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  33.84 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.48 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0272  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.16 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  33.84 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1602  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.41 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0931799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  32.2 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  29.56 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.66 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.65 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2804  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.44 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0569832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2709  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.44 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  32.65 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.24 
 
 		 213 aa  101  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  32.52 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  32.52 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  32.52 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  32.52 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  32.52 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.98 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  32.21 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.47 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.15 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2623  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.44 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  33.16 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.24 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.16 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  28.86 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.96 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.83 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.52 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  32.32 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  32.32 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  32.52 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>