More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3316 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3316  multiple antibiotic resistance protein  100 
 
 		 219 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229288 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  70.64 
 
 		 212 aa  307  8e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  60.19 
 
 		 220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  58.8 
 
 		 213 aa  245  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  50.7 
 
 		 207 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  49.77 
 
 		 208 aa  201  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.7 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  46.83 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.48 
 
 		 214 aa  185  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0155  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.83 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1407  hypothetical protein  39.52 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0713518  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.63 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.63 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.14 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.62 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  37.32 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  35.14 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  36.84 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.32 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.81 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193827  hitchhiker  0.0000682503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.24 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.76 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.05 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  38.03 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10401  hypothetical protein  34.13 
 
 		 205 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  36.71 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.98 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.82 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  35.41 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  35.41 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  35.41 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  36.36 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  36.36 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  36.36 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  35.41 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  36.36 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.82 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  36.36 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  33.33 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  36.15 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  37.32 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  36.32 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  32.86 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  31.9 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.55 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  33.49 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.55 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.76 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5328  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.71 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.33 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  32.86 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6025  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.62 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0264079 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  33.49 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  33.49 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1394  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.06 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.06 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.95 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.83 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.29 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  32.57 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.57 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  33.01 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  33.01 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  33.01 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  33.01 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  33.01 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4013  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.78 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.648921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.04 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  31.58 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  31.58 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.49 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  31.58 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.58 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  31.58 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  33.17 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2046  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.86 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  31.9 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  31.58 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0450  multiple drug resistance protein MarC  32.55 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0439205  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  31.58 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  31.58 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  31.58 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  102  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  30.56 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.85 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  33.97 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.16 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  33.01 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  31.55 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  31.13 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0374  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.774303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  32.66 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.28 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.53 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.73 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  29.41 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  29.41 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  29.41 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>