More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0571 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 214 aa  424  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  51.92 
 
 		 207 aa  218  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  46.48 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.34 
 
 		 205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.04 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  47.14 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  46.12 
 
 		 213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3316  multiple antibiotic resistance protein  46.48 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229288 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0155  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.51 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  39.8 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.24 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.8 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.32 
 
 		 211 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  33.83 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  33.83 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  33.83 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  33.83 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  33.83 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  33.83 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  33.83 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  33.83 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2046  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.8 
 
 		 211 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.31 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  34.31 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.33 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1407  hypothetical protein  32.52 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0713518  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.58 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.04 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.34 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  32.34 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  32.06 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  35.53 
 
 		 221 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.33 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.83 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1641  multiple drug resistance protein MarC  34.01 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01486  predicted transporter  34.01 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2117  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.01 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2143  multiple drug resistance protein MarC  34.01 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.33 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  36.63 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0272  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.09 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01497  hypothetical protein  34.01 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.84 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1676  multiple drug resistance protein MarC  34.01 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1731  multiple drug resistance protein MarC  34.01 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.33 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.84 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2129  multiple drug resistance protein MarC  34.01 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1611  multiple drug resistance protein MarC  34.01 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.84 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.76 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.21 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000442646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  37.37 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.5 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  32.99 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  32.99 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.67 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2141  multiple drug resistance protein MarC  35.5 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0214276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  32.99 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  32.99 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  32.99 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0603  multiple antibiotic resistance MarC-related protein  35.24 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  33.83 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  33.5 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.85 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.81 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1817  multiple drug resistance protein MarC  32.32 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2628  multiple drug resistance protein MarC  32.32 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000653473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.16 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.82 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1707  multiple drug resistance protein MarC  32.32 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0501787  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  36.14 
 
 		 217 aa  104  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.66 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2476  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.52 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3711  multiple antibiotic resistance protein  33.84 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.372343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.93 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.55 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  34 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2079  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.15 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00616176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.66 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.89 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.33 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  33.99 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.66 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.13 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  34 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.15 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  31.86 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  34.15 
 
 		 217 aa  101  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.75 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1763  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.62 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.619286  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.2 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1602  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.66 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0931799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.54 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.66 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.33 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  33.33 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>