More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6435 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1394  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 		 236 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 		 236 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6025  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  97.17 
 
 		 212 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0264079 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  94.34 
 
 		 212 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  66.2 
 
 		 213 aa  268  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  64.79 
 
 		 213 aa  263  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5328  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  65.26 
 
 		 213 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4013  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  63.9 
 
 		 210 aa  234  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.648921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2671  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.89 
 
 		 217 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  34.95 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  34.95 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.95 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  34.95 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  34.95 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  34.95 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  34.95 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  34.95 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  34.95 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  35.61 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  34.95 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  35.61 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  36.84 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  36.84 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  34.47 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  34.47 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  34.47 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  34.47 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  34.47 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  37.44 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.62 
 
 		 207 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.44 
 
 		 207 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  34.15 
 
 		 207 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  33.02 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  32.37 
 
 		 212 aa  111  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  37.98 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  38.03 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  35.78 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  32.2 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.62 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.82 
 
 		 216 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.41 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3316  multiple antibiotic resistance protein  36.06 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  32.55 
 
 		 212 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  37.06 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  29.06 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.86 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.63 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  32.37 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.31 
 
 		 212 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 		 206 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  32.16 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  33.67 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  33.67 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.43 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  33.67 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  33.67 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  33.67 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  33.67 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  33.67 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  33.67 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33 
 
 		 206 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33 
 
 		 206 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  34.45 
 
 		 210 aa  105  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.86 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  34.12 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  34.12 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  35.81 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.78 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.47 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  34.12 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  34.91 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.82 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  32.32 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  33.48 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  33.8 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.47 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.93 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.51 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  33.8 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.61 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.27 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1532  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.71 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000919754  unclonable  2.03359e-19 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.41 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.3 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1407  hypothetical protein  33.97 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0713518  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3711  multiple antibiotic resistance protein  32.7 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.372343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.09 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  33.18 
 
 		 210 aa  99.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2046  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.17 
 
 		 211 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.35 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.35 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>