More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2943 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
205 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  73.04 
 
 
207 aa  301  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  66.67 
 
 
208 aa  274  8e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.02 
 
 
212 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  50.25 
 
 
220 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.34 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  51.72 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3316  multiple antibiotic resistance protein  46.7 
 
 
219 aa  193  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0229288 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  48.22 
 
 
203 aa  181  6e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0155  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.58 
 
 
215 aa  155  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1407  hypothetical protein  37.02 
 
 
210 aa  135  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0713518  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 
206 aa  124  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.96 
 
 
212 aa  122  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.69 
 
 
206 aa  121  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 
213 aa  121  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.51 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.84 
 
 
213 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.65 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.34 
 
 
206 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  32.34 
 
 
206 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  34.5 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  34.5 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  34.5 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  34.5 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  34.5 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  34.5 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  34.5 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  34.5 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.01 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.52 
 
 
204 aa  115  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.32 
 
 
211 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.65 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.32 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  33.5 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.14 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.52 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.14 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.49 
 
 
210 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193827  hitchhiker  0.0000682503 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.58 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.82 
 
 
206 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.14 
 
 
206 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.83 
 
 
231 aa  112  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.95 
 
 
235 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.63 
 
 
206 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 
219 aa  108  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.9 
 
 
212 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559701  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.22 
 
 
219 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2046  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.38 
 
 
211 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32 
 
 
205 aa  108  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  33.03 
 
 
221 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  33.03 
 
 
221 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3711  multiple antibiotic resistance protein  33.67 
 
 
212 aa  106  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.372343  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  33.03 
 
 
221 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  33.03 
 
 
221 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  33.03 
 
 
221 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.33 
 
 
213 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 
213 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  32.49 
 
 
207 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.66 
 
 
209 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.79 
 
 
207 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.24 
 
 
219 aa  104  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  33.66 
 
 
210 aa  105  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 
217 aa  104  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000442646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2476  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.43 
 
 
242 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.33 
 
 
207 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1394  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.41 
 
 
236 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.41 
 
 
236 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  30.29 
 
 
214 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  30.24 
 
 
212 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6025  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.92 
 
 
212 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0264079 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.83 
 
 
207 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.09 
 
 
206 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  30.46 
 
 
203 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  31.09 
 
 
206 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  33.5 
 
 
221 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.02 
 
 
214 aa  102  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0374  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.05 
 
 
214 aa  102  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.774303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.67 
 
 
203 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.61 
 
 
198 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  29.27 
 
 
214 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01486  predicted transporter  30.73 
 
 
221 aa  101  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2117  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.73 
 
 
221 aa  101  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1731  multiple drug resistance protein MarC  30.73 
 
 
221 aa  101  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.09 
 
 
213 aa  101  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01497  hypothetical protein  30.73 
 
 
221 aa  101  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1676  multiple drug resistance protein MarC  30.73 
 
 
221 aa  101  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  31.71 
 
 
217 aa  101  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1641  multiple drug resistance protein MarC  30.73 
 
 
221 aa  101  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  29.74 
 
 
215 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  29.74 
 
 
215 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  29.74 
 
 
215 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  29.74 
 
 
215 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  29.74 
 
 
215 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2143  multiple drug resistance protein MarC  30.73 
 
 
221 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1611  multiple drug resistance protein MarC  30.73 
 
 
221 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  30.35 
 
 
207 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  30.35 
 
 
214 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2129  multiple drug resistance protein MarC  30.73 
 
 
221 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  32.2 
 
 
213 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  30.35 
 
 
214 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>