More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0498 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 219 aa  418  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.28 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.55 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  37.37 
 
 		 207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.07 
 
 		 217 aa  111  8.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.5 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.2 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  36.63 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  36.14 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.54 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2476  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.98 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  32.81 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  32.81 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  32.61 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  33.5 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.98 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  33.67 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.98 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.98 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.666037 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.2 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.68 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  32.02 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.51 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1743  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.37 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565671  normal  0.375082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.64 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.01 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  33.67 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.5 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.5 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.6 
 
 		 217 aa  98.2  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000442646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  31.94 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.43 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  31.53 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.5 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.72 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  32.99 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0603  multiple antibiotic resistance MarC-related protein  33.83 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3711  multiple antibiotic resistance protein  31.53 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.372343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0155  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.85 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2046  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.51 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  31.67 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.1 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  34.2 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 		 207 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.85 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  30.14 
 
 		 213 aa  95.1  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  33.5 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  31.34 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  29.82 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  29.82 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  30.73 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  29.82 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  30.28 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  32.83 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  30.28 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  32.83 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  32.83 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  32.83 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  30.28 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.84 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  30.28 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  30.28 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  32.83 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  32.83 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  32.26 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  32.83 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  32.83 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1602  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.83 
 
 		 248 aa  93.2  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0931799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.21 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2709  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.12 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  30.5 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2804  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.12 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0569832  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.85 
 
 		 201 aa  92  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.37 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2623  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.12 
 
 		 217 aa  91.7  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  32.26 
 
 		 214 aa  91.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  32.26 
 
 		 214 aa  91.7  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  30.61 
 
 		 214 aa  91.7  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.35 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  32.81 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  32.23 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2908  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein protein  35.56 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.275757  normal  0.0232741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1407  hypothetical protein  30.61 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0713518  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  32.66 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.14 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1719  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.68 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.33 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  33.33 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  30.41 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.1 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.92 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>