More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0936 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  47.93 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  39.5 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  38.28 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0053  multiple drug resistance protein MarC  38.81 
 
 		 211 aa  141  9e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1641  multiple drug resistance protein MarC  40.8 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  36.87 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2141  multiple drug resistance protein MarC  38.61 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0214276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  36.84 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01486  predicted transporter  40.3 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2117  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.3 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01497  hypothetical protein  40.3 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1676  multiple drug resistance protein MarC  40.3 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1731  multiple drug resistance protein MarC  40.3 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2143  multiple drug resistance protein MarC  40.3 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2129  multiple drug resistance protein MarC  40.3 
 
 		 221 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1611  multiple drug resistance protein MarC  40.3 
 
 		 221 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  39.8 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  39.8 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  39.8 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  39.8 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2628  multiple drug resistance protein MarC  38.54 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000653473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  39.8 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1817  multiple drug resistance protein MarC  38.54 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  39.11 
 
 		 221 aa  132  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1707  multiple drug resistance protein MarC  38.05 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0501787  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0450  multiple drug resistance protein MarC  37.62 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0439205  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5951  multiple drug resistance protein MarC  38.36 
 
 		 232 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0451  multiple drug resistance protein MarC  34.48 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.986486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68750  multiple drug resistance protein MarC  35.24 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.19 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.4 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.4 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  30.05 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  34.47 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  33.5 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.56 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4291  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.73 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  31.44 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0603  multiple antibiotic resistance MarC-related protein  31.53 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.77 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  26.77 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  27.5 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  32.04 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  27.5 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  27.5 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  27.5 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  27.5 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  27.5 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  27.5 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  27.5 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  26.73 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.26 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.666037 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  29.74 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  31.94 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  29.41 
 
 		 207 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  30.61 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.73 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  31.44 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  30.2 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  28.71 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.19 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  30.61 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  30.61 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.04 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.04 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  32.04 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.67 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  29.27 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.91 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.04 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.36 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  28.65 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.76 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  28.65 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  28.5 
 
 		 207 aa  98.6  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.53 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.09 
 
 		 216 aa  98.6  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  28.65 
 
 		 210 aa  98.6  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.11 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  31.44 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  31.44 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2507  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.78 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.04 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  31.44 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  31.44 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  28.65 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  31.44 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  28.95 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.14 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.61 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.05 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0784  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.14 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.53 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.05 
 
 		 214 aa  96.3  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.28 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  28.12 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0446  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.74 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  27.6 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>