More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0451 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0451  multiple drug resistance protein MarC  100 
 
 		 237 aa  477  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.986486  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  45.87 
 
 		 224 aa  178  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2141  multiple drug resistance protein MarC  46.01 
 
 		 229 aa  178  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0214276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2628  multiple drug resistance protein MarC  47.72 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000653473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1817  multiple drug resistance protein MarC  47.72 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1707  multiple drug resistance protein MarC  47.72 
 
 		 227 aa  174  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0501787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  45.41 
 
 		 224 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  42.79 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01486  predicted transporter  42.66 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2117  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.66 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1676  multiple drug resistance protein MarC  42.66 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01497  hypothetical protein  42.66 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1731  multiple drug resistance protein MarC  42.66 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1641  multiple drug resistance protein MarC  42.66 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2129  multiple drug resistance protein MarC  42.66 
 
 		 221 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2143  multiple drug resistance protein MarC  42.66 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1611  multiple drug resistance protein MarC  42.66 
 
 		 221 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  42.2 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  42.2 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  42.2 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  42.2 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  42.2 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0053  multiple drug resistance protein MarC  43.2 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68750  multiple drug resistance protein MarC  42.92 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5951  multiple drug resistance protein MarC  42.06 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  39.71 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.8 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  37.68 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  35.68 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0450  multiple drug resistance protein MarC  37.14 
 
 		 219 aa  118  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0439205  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  30.35 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  30.35 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  30.35 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  30.35 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  30.35 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  30.35 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  30.35 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  30.35 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.9 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.36 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.36 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.36 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.36 
 
 		 206 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.41 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.36 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  29.9 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.36 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.86 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.5 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  27.86 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  33.81 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  29.44 
 
 		 208 aa  99.4  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.61 
 
 		 211 aa  99  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  33.81 
 
 		 209 aa  98.6  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  31.43 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  31.43 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  30 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  31.43 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  31.43 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  34.98 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  31.43 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  30 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.36 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  29.72 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  30 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  30 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  30.33 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  30 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  30 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  29.72 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.86 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  31.68 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1791  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.64 
 
 		 217 aa  95.5  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0784  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.38 
 
 		 224 aa  95.1  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0372  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.11 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.91 
 
 		 213 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.43 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0344188  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.14 
 
 		 202 aa  92.4  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.47 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  31.61 
 
 		 214 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.16 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  31.61 
 
 		 214 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  30.15 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.15 
 
 		 218 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.87 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  31.61 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3885  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.07 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.16 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1391  hypothetical protein  30.58 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0338274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.86 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.92 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.95 
 
 		 214 aa  90.1  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  31.03 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  31.03 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  31.03 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  31.19 
 
 		 210 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1320  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.23 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  27.45 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.95 
 
 		 210 aa  89.7  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>