More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0784 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0784  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0573  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.25 
 
 		 227 aa  225  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4291  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.25 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1391  hypothetical protein  40.85 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0338274  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1407  MarC membrane protein  40.38 
 
 		 412 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0010  membrane efflux protein  40.38 
 
 		 412 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1493  putative membrane efflux protein  40.38 
 
 		 412 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191145  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.21 
 
 		 223 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0344188  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4420  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.21 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6440  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.86 
 
 		 240 aa  134  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.74 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1320  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.56 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3136  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.86 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0838279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5311  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.97 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3841  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.79 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.79 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5777  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.79 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0266  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.16 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0431  hypothetical protein  38.03 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0153  hypothetical protein  38.03 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642552  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1193  hypothetical protein  38.03 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953041  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1147  hypothetical protein  38.03 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1297  multiple antibiotic resistance (MarC)- related proteins  38.86 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00195528  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1888  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.1 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0446  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.03 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2436  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.03 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  33.65 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3885  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.76 
 
 		 233 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2731  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.84 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.84 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2508  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.84 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120905  normal  0.115673 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.15 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3203  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.15 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.98 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0915  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.61 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0866408 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.98 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4212  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.32 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.420393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.19 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  30.48 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2065  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.63 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.66 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  32.23 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.4 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  30 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  32.7 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  29.67 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  30.54 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  30.29 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  29.13 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  29.52 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2507  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.45 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  27.8 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  27.8 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  27.8 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  27.8 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  27.8 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  27.8 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  27.8 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  30.84 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  27.8 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  30.05 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  30.05 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2141  multiple drug resistance protein MarC  31.22 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0214276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  30.88 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  30.05 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.56 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  28.64 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  30.05 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  29.58 
 
 		 224 aa  98.6  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.29 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.05 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  29.11 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.44 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  29.13 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.09 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.77 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.44 
 
 		 206 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.44 
 
 		 206 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.83 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.32 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.46 
 
 		 206 aa  95.9  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.34 
 
 		 206 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  28.64 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.64 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  28.64 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.33 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  28.64 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  28.64 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.22 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  29.33 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  28.64 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  28.64 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.44 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.96 
 
 		 213 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  30 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3245  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  25.85 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.33 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  30 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.1 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>