More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3957 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 		 241 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4420  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  99.55 
 
 		 223 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1320  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  92.83 
 
 		 223 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  92.38 
 
 		 223 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0344188  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5777  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  91.15 
 
 		 227 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3841  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  91.15 
 
 		 227 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  91.15 
 
 		 227 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0010  membrane efflux protein  81.3 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1493  putative membrane efflux protein  80.87 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191145  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1391  hypothetical protein  80.6 
 
 		 238 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0338274  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1407  MarC membrane protein  81.3 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1193  hypothetical protein  78.26 
 
 		 234 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953041  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1147  hypothetical protein  78.26 
 
 		 234 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0431  hypothetical protein  78.92 
 
 		 215 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0153  hypothetical protein  78.92 
 
 		 215 aa  348  6e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642552  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5311  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  69.27 
 
 		 225 aa  293  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3136  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  67.43 
 
 		 223 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0838279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4212  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  68.81 
 
 		 220 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.420393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1297  multiple antibiotic resistance (MarC)- related proteins  69.27 
 
 		 225 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00195528  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  64.71 
 
 		 222 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3203  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  64.71 
 
 		 222 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2731  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.29 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2508  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.29 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120905  normal  0.115673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2436  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.05 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6440  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.56 
 
 		 240 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0915  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.75 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0866408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1888  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.07 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0573  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.42 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0266  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.8 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4291  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.81 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0446  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.96 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0784  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.97 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2065  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.6 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2507  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.21 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0053  multiple drug resistance protein MarC  32.66 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3885  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.06 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.54 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  32.67 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.23 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  29.6 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  28.7 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  31.82 
 
 		 212 aa  96.3  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  32.83 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  32.2 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  30.43 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  31.47 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  30 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  30 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  30 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  30 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  30 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  30 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.95 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1641  multiple drug resistance protein MarC  32.18 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2141  multiple drug resistance protein MarC  31.84 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0214276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  31.5 
 
 		 218 aa  92.4  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01486  predicted transporter  31.71 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2117  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.71 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1731  multiple drug resistance protein MarC  31.71 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1676  multiple drug resistance protein MarC  31.71 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01497  hypothetical protein  31.71 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2143  multiple drug resistance protein MarC  31.71 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.95 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2129  multiple drug resistance protein MarC  31.68 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.47 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1611  multiple drug resistance protein MarC  31.68 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1817  multiple drug resistance protein MarC  30.46 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.47 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.47 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.47 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.2 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2628  multiple drug resistance protein MarC  30.46 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000653473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.19 
 
 		 206 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  29.21 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1707  multiple drug resistance protein MarC  30.46 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0501787  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  32.84 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  30.88 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.47 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  30.88 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  30.88 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  28.5 
 
 		 206 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  30.88 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  30.88 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.02 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.95 
 
 		 225 aa  89  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  31.1 
 
 		 215 aa  88.6  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  28.5 
 
 		 217 aa  88.6  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  31.98 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  32.99 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0451  multiple drug resistance protein MarC  30.96 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.986486  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  31.82 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  31.82 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  31.82 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.8 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  31.82 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  32.49 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  31.16 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>