More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1888 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1888  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 229 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2065  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  51 
 
 		 259 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2731  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50.46 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2508  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120905  normal  0.115673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2436  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50.93 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0266  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.3 
 
 		 243 aa  189  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0915  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  51.58 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0866408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0446  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50.44 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2507  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.29 
 
 		 227 aa  164  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3136  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.6 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0838279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4420  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.53 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1391  hypothetical protein  40.93 
 
 		 238 aa  138  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0338274  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.6 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0344188  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.07 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0010  membrane efflux protein  40.47 
 
 		 412 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1407  MarC membrane protein  40.47 
 
 		 412 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1493  putative membrane efflux protein  40.47 
 
 		 412 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191145  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1320  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.25 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5777  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.25 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3841  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.25 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.25 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5311  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.34 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1297  multiple antibiotic resistance (MarC)- related proteins  40.87 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00195528  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6440  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.67 
 
 		 240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.94 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3203  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.94 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0784  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.1 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0431  hypothetical protein  39.07 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0153  hypothetical protein  39.07 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642552  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1193  hypothetical protein  39.07 
 
 		 234 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953041  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1147  hypothetical protein  39.07 
 
 		 234 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4291  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.01 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4212  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.2 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.420393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3885  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.61 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0573  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.01 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.56 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  30.77 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  29.86 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.8 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  27.01 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  29.95 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5951  multiple drug resistance protein MarC  30.04 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  28.16 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68750  multiple drug resistance protein MarC  30.84 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  33.95 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  27.94 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  26.09 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.47 
 
 		 213 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  27.94 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  26.96 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  26.96 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  29.47 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  29.47 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  29.47 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  29.47 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  29.47 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.23 
 
 		 198 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.1 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  33.17 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2141  multiple drug resistance protein MarC  29.72 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0214276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.37 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  33.17 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.62 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  28.43 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  26.96 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  26.96 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  26.96 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.76 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  31.55 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.4 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.05 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  24.64 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01486  predicted transporter  29.56 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2117  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.56 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1731  multiple drug resistance protein MarC  29.56 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01497  hypothetical protein  29.56 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1676  multiple drug resistance protein MarC  28.99 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1641  multiple drug resistance protein MarC  29.56 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  29.56 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2129  multiple drug resistance protein MarC  29.56 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1611  multiple drug resistance protein MarC  29.56 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  26.47 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  29.33 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2143  multiple drug resistance protein MarC  29.56 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  24.17 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1817  multiple drug resistance protein MarC  28.29 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2628  multiple drug resistance protein MarC  28.29 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000653473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  26.47 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  26.47 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  26.47 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  26.47 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  26.47 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  26.07 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  24.17 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.17 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.46 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.11 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0451  multiple drug resistance protein MarC  29.17 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.986486  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.12 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  25.59 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>