More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_68750 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_68750  multiple drug resistance protein MarC  100 
 
 		 233 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5951  multiple drug resistance protein MarC  95.71 
 
 		 232 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  52.91 
 
 		 224 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  52.02 
 
 		 224 aa  229  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2141  multiple drug resistance protein MarC  52.7 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0214276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1817  multiple drug resistance protein MarC  51.35 
 
 		 227 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2628  multiple drug resistance protein MarC  51.35 
 
 		 227 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000653473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1707  multiple drug resistance protein MarC  50.9 
 
 		 227 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0501787  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01486  predicted transporter  51.11 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2117  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  51.11 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1676  multiple drug resistance protein MarC  51.11 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  51.77 
 
 		 221 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1731  multiple drug resistance protein MarC  51.11 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  51.77 
 
 		 221 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01497  hypothetical protein  51.11 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  51.77 
 
 		 221 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  51.77 
 
 		 221 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1641  multiple drug resistance protein MarC  51.11 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  51.33 
 
 		 221 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2129  multiple drug resistance protein MarC  51.12 
 
 		 221 aa  205  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2143  multiple drug resistance protein MarC  51.11 
 
 		 221 aa  205  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1611  multiple drug resistance protein MarC  51.12 
 
 		 221 aa  205  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  51.69 
 
 		 221 aa  204  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0053  multiple drug resistance protein MarC  46.73 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  38.76 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0451  multiple drug resistance protein MarC  42.92 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.986486  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  35.14 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  38.03 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.24 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0450  multiple drug resistance protein MarC  35.19 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0439205  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.08 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  32.43 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  30.18 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  32.09 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.49 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  31.6 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  32.86 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  32.86 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  32.86 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  32.86 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  32.86 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.14 
 
 		 214 aa  99  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1791  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.49 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  32.55 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.55 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  32.55 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  31.28 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2731  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.92 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  32.55 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  31.28 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  32.55 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  32.55 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2508  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.92 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120905  normal  0.115673 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  30.33 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1602  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.03 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0931799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.22 
 
 		 217 aa  95.5  7e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1888  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.84 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  30.35 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  28.1 
 
 		 214 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.09 
 
 		 208 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2507  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.49 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  30.14 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.04 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000442646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2436  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.64 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.61 
 
 		 216 aa  89.7  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  31.16 
 
 		 207 aa  89.4  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  29.68 
 
 		 209 aa  89.4  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.75 
 
 		 206 aa  89.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2476  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.43 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  30.2 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0266  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.14 
 
 		 243 aa  88.6  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  30.24 
 
 		 212 aa  88.6  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.92 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4291  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.19 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.56 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  31.71 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1320  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.31 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1391  hypothetical protein  28.97 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0338274  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.14 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.7 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4420  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.58 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5777  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.58 
 
 		 227 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3841  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.58 
 
 		 227 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.37 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.58 
 
 		 227 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  32.37 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.84 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6440  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.84 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0446  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.36 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  29.44 
 
 		 216 aa  85.9  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.59 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.27 
 
 		 206 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.27 
 
 		 206 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.27 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.23 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.8 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>