More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4291 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4291  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0573  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  56.72 
 
 
227 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0784  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.76 
 
 
224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6440  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.98 
 
 
240 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3885  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.55 
 
 
233 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1391  hypothetical protein  39.23 
 
 
238 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0338274  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.25 
 
 
223 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0344188  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3136  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.46 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0838279  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1493  putative membrane efflux protein  38.76 
 
 
412 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191145  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4420  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.81 
 
 
223 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314692  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0010  membrane efflux protein  38.76 
 
 
412 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1407  MarC membrane protein  38.76 
 
 
412 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.81 
 
 
241 aa  131  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571495  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1320  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.81 
 
 
223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3841  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  40.78 
 
 
227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5777  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.78 
 
 
227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782432  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  40.78 
 
 
227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171446  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0266  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.99 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5311  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.38 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500133  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2436  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.65 
 
 
229 aa  124  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  32.55 
 
 
218 aa  122  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0446  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.73 
 
 
235 aa  121  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2065  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.1 
 
 
259 aa  121  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0153  hypothetical protein  37.32 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0431  hypothetical protein  37.32 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380302  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1193  hypothetical protein  37.32 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953041  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1147  hypothetical protein  37.32 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1888  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.01 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2731  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.43 
 
 
231 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2508  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.43 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120905  normal  0.115673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2507  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357555  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0915  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.28 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0866408 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1297  multiple antibiotic resistance (MarC)- related proteins  39.32 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00195528  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.46 
 
 
231 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4212  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.81 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.420393  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.5 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3203  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.5 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.73 
 
 
225 aa  106  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.8 
 
 
205 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  29.22 
 
 
217 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.85 
 
 
217 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  29.03 
 
 
213 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  33 
 
 
221 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  29.36 
 
 
210 aa  101  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  32.38 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  32.38 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  32.38 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  32.38 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  32.38 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  27.75 
 
 
207 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  32.38 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  32.38 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  32.38 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0450  multiple drug resistance protein MarC  29.22 
 
 
219 aa  99  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0439205  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  28.85 
 
 
214 aa  98.6  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  28.85 
 
 
214 aa  98.6  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  29.05 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.52 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  32.38 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  29.17 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  29.17 
 
 
210 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  29.17 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  28.37 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  27.65 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  28.1 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.4 
 
 
210 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193827  hitchhiker  0.0000682503 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  32.71 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  28.64 
 
 
214 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  28.37 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  28.37 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  28.37 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  28.37 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  28.37 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  30.66 
 
 
212 aa  95.1  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.32 
 
 
212 aa  95.1  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  28.91 
 
 
210 aa  95.1  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.28 
 
 
207 aa  94.7  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01486  predicted transporter  32.02 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2117  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.02 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01497  hypothetical protein  32.02 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1676  multiple drug resistance protein MarC  32.02 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1731  multiple drug resistance protein MarC  32.02 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1641  multiple drug resistance protein MarC  32.02 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2143  multiple drug resistance protein MarC  32.02 
 
 
221 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  28.37 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1611  multiple drug resistance protein MarC  32.02 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  29.67 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2129  multiple drug resistance protein MarC  32.02 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  28.84 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  27.31 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  28.84 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.16 
 
 
213 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  28.84 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  27.31 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  28.84 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  27.31 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  29.3 
 
 
212 aa  93.2  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.37 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  28.84 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  28.84 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>