More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0266 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0266  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 243 aa  460  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2065  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.36 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2436  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.52 
 
 		 229 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2507  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.55 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2731  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.88 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2508  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.88 
 
 		 231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120905  normal  0.115673 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1888  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.3 
 
 		 229 aa  189  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0446  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.25 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0915  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.89 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0866408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3136  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.78 
 
 		 223 aa  138  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0838279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1493  putative membrane efflux protein  38.76 
 
 		 412 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191145  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6440  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.57 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0010  membrane efflux protein  38.76 
 
 		 412 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1407  MarC membrane protein  38.76 
 
 		 412 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5311  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.62 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1391  hypothetical protein  37.8 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0338274  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.8 
 
 		 241 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1320  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.8 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4420  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.8 
 
 		 223 aa  131  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.84 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0344188  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3841  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.8 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.8 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5777  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.8 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4291  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.99 
 
 		 227 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1297  multiple antibiotic resistance (MarC)- related proteins  40 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00195528  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0573  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.22 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0784  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.68 
 
 		 224 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4212  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.21 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.420393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1193  hypothetical protein  36.84 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953041  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1147  hypothetical protein  36.84 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0431  hypothetical protein  36.84 
 
 		 215 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0153  hypothetical protein  36.84 
 
 		 215 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642552  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.81 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3203  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.81 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  29.58 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3885  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.48 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  30.56 
 
 		 207 aa  102  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  30.14 
 
 		 212 aa  102  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.43 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  30.14 
 
 		 213 aa  99  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  28.78 
 
 		 207 aa  98.6  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  33.82 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.73 
 
 		 205 aa  95.5  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  31.96 
 
 		 214 aa  95.9  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  33.98 
 
 		 216 aa  95.1  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.98 
 
 		 218 aa  95.1  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  29.55 
 
 		 215 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  29.55 
 
 		 215 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  32.2 
 
 		 214 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  29.55 
 
 		 215 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  29.55 
 
 		 215 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  29.55 
 
 		 215 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.63 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  32.02 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  32.02 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  32.08 
 
 		 214 aa  92  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  29.09 
 
 		 215 aa  92  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.09 
 
 		 215 aa  92  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  29.09 
 
 		 215 aa  92  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  29.09 
 
 		 215 aa  92  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  29.09 
 
 		 215 aa  92  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  29.09 
 
 		 215 aa  92  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  29.09 
 
 		 215 aa  92  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  29.09 
 
 		 215 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  28.64 
 
 		 215 aa  91.7  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  29.28 
 
 		 210 aa  91.7  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  29.09 
 
 		 215 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  29.27 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  29.13 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  29.13 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.36 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  29.13 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  29.65 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  29.13 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.17 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  29.19 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  29.22 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.56 
 
 		 217 aa  89  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.67 
 
 		 198 aa  88.6  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.57 
 
 		 208 aa  88.6  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68750  multiple drug resistance protein MarC  28.14 
 
 		 233 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  28.64 
 
 		 203 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.66 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  28.29 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  28.29 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  28.29 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.09 
 
 		 213 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.48 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  28.17 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  28.29 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  30.85 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.01 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  30.85 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.09 
 
 		 213 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.16 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  27.52 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2671  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.18 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  28.3 
 
 		 210 aa  85.9  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.09 
 
 		 213 aa  85.5  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.22 
 
 		 207 aa  85.5  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>