More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0654 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  68.54 
 
 		 217 aa  290  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0450  multiple drug resistance protein MarC  68.6 
 
 		 219 aa  276  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0439205  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2141  multiple drug resistance protein MarC  39.3 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0214276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.5 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  37.32 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1817  multiple drug resistance protein MarC  37 
 
 		 227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2628  multiple drug resistance protein MarC  37 
 
 		 227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000653473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  36.36 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0053  multiple drug resistance protein MarC  38.69 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1707  multiple drug resistance protein MarC  37 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0501787  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  40.31 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0451  multiple drug resistance protein MarC  39 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.986486  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  35.96 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  35.96 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  35.96 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  35.96 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  35.96 
 
 		 221 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  37.37 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01486  predicted transporter  37.31 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2117  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.31 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01497  hypothetical protein  37.31 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1676  multiple drug resistance protein MarC  37.31 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1731  multiple drug resistance protein MarC  37.31 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2143  multiple drug resistance protein MarC  37.31 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1641  multiple drug resistance protein MarC  36.45 
 
 		 221 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  35.96 
 
 		 212 aa  128  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2129  multiple drug resistance protein MarC  37.31 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1611  multiple drug resistance protein MarC  37.31 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  36.14 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68750  multiple drug resistance protein MarC  38.03 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5951  multiple drug resistance protein MarC  36.15 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.63 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2476  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.05 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.55 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  35.35 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.35 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.47 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.16 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  30.1 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  30.1 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  30.1 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.1 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.78 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  30.61 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  30.1 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.75 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.85 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  30.1 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  30.61 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  30.61 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  30.1 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  30.1 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  30.61 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  30.1 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  30.61 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3316  multiple antibiotic resistance protein  33.33 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.56 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  34.69 
 
 		 206 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  34.69 
 
 		 206 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  34.69 
 
 		 206 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  34.69 
 
 		 206 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  34.69 
 
 		 206 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  34.69 
 
 		 206 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  34.69 
 
 		 206 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  34.69 
 
 		 206 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  31.94 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  34 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  32.2 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  34 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.87 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  32.21 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.51 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  28.36 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.5 
 
 		 206 aa  104  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  34 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  32.54 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.65 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.84 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  30.33 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.66 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  31.63 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  29.7 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  29.7 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  29.7 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  30.73 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.65 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  32.31 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2645  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.57 
 
 		 201 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.33 
 
 		 217 aa  101  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  31.73 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  32.31 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>