More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3136 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3136  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 223 aa  440  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0838279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0010  membrane efflux protein  70.64 
 
 		 412 aa  316  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1493  putative membrane efflux protein  70.64 
 
 		 412 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191145  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1407  MarC membrane protein  70.64 
 
 		 412 aa  316  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1391  hypothetical protein  71.56 
 
 		 238 aa  316  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0338274  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5311  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  73.39 
 
 		 225 aa  305  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  67.89 
 
 		 223 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0344188  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4420  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  67.43 
 
 		 223 aa  297  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  67.43 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5777  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  67.43 
 
 		 227 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1320  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  66.51 
 
 		 223 aa  295  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3841  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  67.43 
 
 		 227 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  67.43 
 
 		 227 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0153  hypothetical protein  66.97 
 
 		 215 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0431  hypothetical protein  66.97 
 
 		 215 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380302  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1193  hypothetical protein  66.97 
 
 		 234 aa  287  8e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953041  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1147  hypothetical protein  66.97 
 
 		 234 aa  287  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1297  multiple antibiotic resistance (MarC)- related proteins  72.48 
 
 		 225 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00195528  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  61.54 
 
 		 222 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3203  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  61.54 
 
 		 222 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4212  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  61.86 
 
 		 220 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.420393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2731  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.22 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2508  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.22 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120905  normal  0.115673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2436  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.15 
 
 		 229 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0915  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.43 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0866408 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6440  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.53 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1888  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.6 
 
 		 229 aa  148  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0266  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.78 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0446  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.03 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2065  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.45 
 
 		 259 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4291  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.46 
 
 		 227 aa  141  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0573  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.94 
 
 		 227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3885  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.92 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0784  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.86 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2507  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.07 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.37 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0053  multiple drug resistance protein MarC  30.65 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  30.14 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.96 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.96 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.96 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  30.39 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  28.77 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  32.54 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.88 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.58 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  32.54 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  32.54 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  32.54 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.18 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  32.54 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  32.54 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  32.54 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  32.54 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  32.54 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  31.47 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.88 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1707  multiple drug resistance protein MarC  31.31 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0501787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2628  multiple drug resistance protein MarC  31.31 
 
 		 227 aa  98.2  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000653473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1817  multiple drug resistance protein MarC  31.31 
 
 		 227 aa  98.2  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2141  multiple drug resistance protein MarC  31 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0214276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.99 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.71 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.54 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.71 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.06 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0372  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1641  multiple drug resistance protein MarC  30.69 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  33 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.06 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.71 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.33 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  30.65 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.01 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3245  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.61 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  32.16 
 
 		 208 aa  95.9  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01486  predicted transporter  30.2 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2117  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.2 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1731  multiple drug resistance protein MarC  30.2 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01497  hypothetical protein  30.2 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1676  multiple drug resistance protein MarC  30.2 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1611  multiple drug resistance protein MarC  31.66 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  29.21 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2129  multiple drug resistance protein MarC  31.66 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  31.47 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2143  multiple drug resistance protein MarC  30.2 
 
 		 221 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.28 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  31.12 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  30.35 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  30.5 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  30.5 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  30.5 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  30.5 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  31.47 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0451  multiple drug resistance protein MarC  30.77 
 
 		 237 aa  92  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.986486  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.37 
 
 		 202 aa  92  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.88 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  29.65 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  30.5 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.9 
 
 		 212 aa  91.7  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>