More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0053 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007984  BCI_0053  multiple drug resistance protein MarC  100 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  58.37 
 
 		 224 aa  256  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  57.47 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2141  multiple drug resistance protein MarC  62.84 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0214276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2628  multiple drug resistance protein MarC  64.76 
 
 		 227 aa  247  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000653473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1817  multiple drug resistance protein MarC  64.76 
 
 		 227 aa  247  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01486  predicted transporter  62.67 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2117  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  62.67 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1641  multiple drug resistance protein MarC  62.67 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1731  multiple drug resistance protein MarC  62.67 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1676  multiple drug resistance protein MarC  62.67 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01497  hypothetical protein  62.67 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1707  multiple drug resistance protein MarC  64.29 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0501787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  61.75 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  61.75 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2143  multiple drug resistance protein MarC  62.67 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  61.75 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  61.75 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2129  multiple drug resistance protein MarC  62.21 
 
 		 221 aa  245  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1611  multiple drug resistance protein MarC  62.21 
 
 		 221 aa  245  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  61.75 
 
 		 221 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  60.83 
 
 		 221 aa  238  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5951  multiple drug resistance protein MarC  47.66 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68750  multiple drug resistance protein MarC  47.2 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0451  multiple drug resistance protein MarC  43.3 
 
 		 237 aa  154  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.986486  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  40.7 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.92 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  40.1 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0450  multiple drug resistance protein MarC  34.6 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0439205  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  36.23 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5777  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.33 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3841  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.33 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.33 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1320  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.83 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  34.85 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.84 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.68 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4420  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.84 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  33.17 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  34.17 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  34.17 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  30.65 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  34.17 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  29.8 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  32.67 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.18 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  30.81 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  29.8 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  29.8 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  32.84 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  32.84 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  32.84 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  32.84 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  32.84 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  31.84 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.34 
 
 		 223 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0344188  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  33.17 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  32.66 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  34.67 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  32.16 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.16 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1391  hypothetical protein  31.16 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0338274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  32.16 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  32.16 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  32.16 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  32.16 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  32.16 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  32.16 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2507  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  32.16 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  34.17 
 
 		 210 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  28.28 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  30.73 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  30.73 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  30.73 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  30.73 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  30.73 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  30.73 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  33.16 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  30.73 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  30.73 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  30.96 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0010  membrane efflux protein  31.5 
 
 		 412 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  33.67 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  33.67 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  33.67 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  33.67 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1407  MarC membrane protein  31.5 
 
 		 412 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  32.16 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1493  putative membrane efflux protein  31.5 
 
 		 412 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  33.17 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.5 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.85 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.5 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.5 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2731  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.38 
 
 		 231 aa  101  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.24 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2508  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.91 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120905  normal  0.115673 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.76 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.46 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>