More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1193 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1193  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953041  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1147  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0010  membrane efflux protein  96.69 
 
 
412 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1407  MarC membrane protein  96.69 
 
 
412 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1493  putative membrane efflux protein  96.28 
 
 
412 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191145  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1391  hypothetical protein  93.22 
 
 
238 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0338274  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0153  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0431  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380302  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  80.72 
 
 
223 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0344188  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  78.26 
 
 
241 aa  352  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571495  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4420  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  78.92 
 
 
223 aa  347  9e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314692  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1320  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  77.13 
 
 
223 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5777  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  76.23 
 
 
227 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782432  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3841  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  76.23 
 
 
227 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  76.23 
 
 
227 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171446  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3136  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  66.06 
 
 
223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0838279  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5311  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  67.43 
 
 
225 aa  272  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500133  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  64.25 
 
 
222 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3203  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  64.25 
 
 
222 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4212  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  65.3 
 
 
220 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.420393  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1297  multiple antibiotic resistance (MarC)- related proteins  66.97 
 
 
225 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00195528  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2731  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.38 
 
 
231 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2508  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.38 
 
 
231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120905  normal  0.115673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2436  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.73 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0573  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.57 
 
 
227 aa  131  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6440  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.96 
 
 
240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1888  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.07 
 
 
229 aa  121  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4291  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.32 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0784  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.79 
 
 
224 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0915  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.62 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0866408 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2507  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.35 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357555  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0266  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.84 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0446  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.68 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2065  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.8 
 
 
259 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3885  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.06 
 
 
233 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.43 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0053  multiple drug resistance protein MarC  30 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  30.09 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  29 
 
 
221 aa  85.5  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  31.43 
 
 
206 aa  85.1  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  31.43 
 
 
206 aa  85.1  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  31.43 
 
 
206 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2628  multiple drug resistance protein MarC  30.3 
 
 
227 aa  85.1  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000653473  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  31.43 
 
 
206 aa  85.1  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  31.43 
 
 
206 aa  85.1  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  31.43 
 
 
206 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  31.43 
 
 
206 aa  85.1  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1817  multiple drug resistance protein MarC  30.3 
 
 
227 aa  85.1  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  31.43 
 
 
206 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1707  multiple drug resistance protein MarC  30.3 
 
 
227 aa  85.1  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0501787  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.43 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.77 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  27.15 
 
 
224 aa  82  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.48 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  30.33 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.15 
 
 
207 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  28.86 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2129  multiple drug resistance protein MarC  28.36 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.2 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1611  multiple drug resistance protein MarC  28.36 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  27.09 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  26.24 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01486  predicted transporter  28.36 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2117  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.36 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666944  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  30.73 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1731  multiple drug resistance protein MarC  28.36 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1641  multiple drug resistance protein MarC  28.36 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1676  multiple drug resistance protein MarC  28.36 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  30.88 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01497  hypothetical protein  28.36 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2143  multiple drug resistance protein MarC  28.36 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2141  multiple drug resistance protein MarC  28.5 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0214276  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  29.21 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.52 
 
 
206 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.38 
 
 
206 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.05 
 
 
206 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.71 
 
 
205 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 
206 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  29.33 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  29.15 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  29.33 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  29.15 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  29.15 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  29.33 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  29.33 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  29.15 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  29.15 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  29.33 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0451  multiple drug resistance protein MarC  30.1 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.986486  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  30.48 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  29.85 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  28.5 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.78 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0372  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.07 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0450  multiple drug resistance protein MarC  27.86 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0439205  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  29.9 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  25.96 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>