More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2507 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2507  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 227 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0266  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.55 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2436  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  55.66 
 
 		 229 aa  207  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2508  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.27 
 
 		 231 aa  203  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120905  normal  0.115673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2731  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.49 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2065  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.16 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0446  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.28 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0915  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.92 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0866408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1888  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.29 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1391  hypothetical protein  41.67 
 
 		 238 aa  141  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0338274  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6440  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.33 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0573  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.5 
 
 		 227 aa  138  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1493  putative membrane efflux protein  41.2 
 
 		 412 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191145  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0010  membrane efflux protein  41.2 
 
 		 412 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1407  MarC membrane protein  41.2 
 
 		 412 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4291  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.47 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5777  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.98 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3841  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.98 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.98 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1320  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.98 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.21 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.8 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0344188  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3136  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.07 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0838279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4420  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.8 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5311  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.21 
 
 		 225 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500133  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1193  hypothetical protein  39.35 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953041  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1147  hypothetical protein  39.35 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0431  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0153  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642552  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4212  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.73 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.420393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1297  multiple antibiotic resistance (MarC)- related proteins  38.14 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00195528  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  35.41 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  34.98 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  34.98 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  34.98 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  34.98 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.41 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3203  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.41 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  34.12 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0784  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.45 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3885  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.89 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.05 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.78 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  33.84 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  32.69 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1817  multiple drug resistance protein MarC  33.17 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2628  multiple drug resistance protein MarC  33.17 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000653473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  32.32 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  32.51 
 
 		 217 aa  105  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  32 
 
 		 207 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1676  multiple drug resistance protein MarC  33.17 
 
 		 221 aa  104  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01486  predicted transporter  33.33 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2117  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01497  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1611  multiple drug resistance protein MarC  33.33 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2129  multiple drug resistance protein MarC  33.33 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.84 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2143  multiple drug resistance protein MarC  33.17 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1731  multiple drug resistance protein MarC  33.33 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1641  multiple drug resistance protein MarC  32.47 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0053  multiple drug resistance protein MarC  32.37 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1707  multiple drug resistance protein MarC  32.67 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0501787  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  31.34 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  29.95 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  30.69 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2141  multiple drug resistance protein MarC  31.53 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0214276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68750  multiple drug resistance protein MarC  33.82 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  29.35 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  32.52 
 
 		 217 aa  98.6  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  28.86 
 
 		 215 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  28.86 
 
 		 215 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  28.86 
 
 		 215 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  28.86 
 
 		 215 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  28.86 
 
 		 215 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  29.33 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0450  multiple drug resistance protein MarC  33.81 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0439205  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  30.35 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5951  multiple drug resistance protein MarC  33.33 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  30.52 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  29.81 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  29.81 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  29.81 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  29.81 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  32.85 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.18 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  29.76 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  30.2 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  28.85 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  28.85 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.33 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  28.85 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  28.85 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 		 209 aa  92.4  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  29.7 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.85 
 
 		 207 aa  92.4  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  32.06 
 
 		 220 aa  92  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  26.79 
 
 		 203 aa  91.7  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.88 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  28.22 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  29.7 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>