More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1110 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  100 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  96.88 
 
 		 224 aa  431  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  71.88 
 
 		 221 aa  302  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  70.09 
 
 		 221 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  70.09 
 
 		 221 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  70.09 
 
 		 221 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  70.09 
 
 		 221 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01486  predicted transporter  70.98 
 
 		 221 aa  298  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2117  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  70.98 
 
 		 221 aa  298  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01497  hypothetical protein  70.98 
 
 		 221 aa  298  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1731  multiple drug resistance protein MarC  70.98 
 
 		 221 aa  298  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  70.09 
 
 		 221 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1676  multiple drug resistance protein MarC  70.98 
 
 		 221 aa  297  7e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2143  multiple drug resistance protein MarC  70.98 
 
 		 221 aa  296  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1641  multiple drug resistance protein MarC  70.54 
 
 		 221 aa  297  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2129  multiple drug resistance protein MarC  70.54 
 
 		 221 aa  296  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1611  multiple drug resistance protein MarC  70.54 
 
 		 221 aa  296  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2141  multiple drug resistance protein MarC  70.4 
 
 		 229 aa  290  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0214276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1817  multiple drug resistance protein MarC  66.02 
 
 		 227 aa  277  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2628  multiple drug resistance protein MarC  66.02 
 
 		 227 aa  277  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000653473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1707  multiple drug resistance protein MarC  65.53 
 
 		 227 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0501787  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0053  multiple drug resistance protein MarC  56.56 
 
 		 211 aa  242  3e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5951  multiple drug resistance protein MarC  52.02 
 
 		 232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68750  multiple drug resistance protein MarC  52.91 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0451  multiple drug resistance protein MarC  46.38 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.986486  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  36.89 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.28 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  34.45 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  36.36 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0450  multiple drug resistance protein MarC  37.33 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0439205  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  34.69 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.82 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  34.69 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.63 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  36.89 
 
 		 213 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  37.38 
 
 		 210 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  35.44 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.9 
 
 		 206 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.9 
 
 		 206 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  32.34 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  36.41 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.09 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.56 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.43 
 
 		 206 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  32.34 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.43 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  32.67 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.43 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  32.34 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  31.63 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2507  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.84 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  36.22 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  31.84 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  31.84 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  31.84 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  31.84 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  31.84 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  31.84 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  31.84 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  31.84 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  34.33 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.76 
 
 		 202 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2508  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.7 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120905  normal  0.115673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2436  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.88 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3316  multiple antibiotic resistance protein  32.66 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.61 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  30.88 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.14 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0784  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.67 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  35.44 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  36.41 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.6 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  36.41 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0446  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.22 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  36.89 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  36.89 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  36.89 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  36.89 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  35.92 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4420  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.6 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2731  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.23 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  30.35 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  32.34 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  32.34 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  32.34 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  32.34 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  32.34 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.86 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0344188  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  36.41 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  36.41 
 
 		 210 aa  98.6  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2065  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.2 
 
 		 259 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1320  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.77 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.85 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  30.85 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  30.85 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.2 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  30.85 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>