More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2436 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2436  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 229 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2508  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  95.24 
 
 		 231 aa  417  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120905  normal  0.115673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2731  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  94.37 
 
 		 231 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2065  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  61.09 
 
 		 259 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0915  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  63.03 
 
 		 237 aa  258  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0866408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0446  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  61.04 
 
 		 235 aa  255  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0266  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.52 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2507  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  55.66 
 
 		 227 aa  194  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1888  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50.93 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3136  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.15 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0838279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1391  hypothetical protein  42.41 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0338274  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5311  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.09 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0010  membrane efflux protein  42.86 
 
 		 412 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1407  MarC membrane protein  42.86 
 
 		 412 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1493  putative membrane efflux protein  42.86 
 
 		 412 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191145  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1297  multiple antibiotic resistance (MarC)- related proteins  40.99 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00195528  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.05 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.39 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0344188  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4420  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.18 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1320  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.91 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3841  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.05 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5777  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.05 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.05 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4212  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.48 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.420393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.39 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3203  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.39 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0431  hypothetical protein  39.73 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0153  hypothetical protein  39.73 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642552  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1193  hypothetical protein  39.73 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953041  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1147  hypothetical protein  39.73 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6440  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.91 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4291  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.65 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0784  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.03 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3885  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.28 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0573  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.58 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  30.39 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  30.88 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.7 
 
 		 231 aa  98.6  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1641  multiple drug resistance protein MarC  31.73 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  29.49 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2129  multiple drug resistance protein MarC  31.25 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1676  multiple drug resistance protein MarC  31.25 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1611  multiple drug resistance protein MarC  31.25 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01486  predicted transporter  31.25 
 
 		 221 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2117  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.25 
 
 		 221 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1731  multiple drug resistance protein MarC  31.25 
 
 		 221 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01497  hypothetical protein  31.25 
 
 		 221 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.9 
 
 		 216 aa  95.5  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2143  multiple drug resistance protein MarC  31.25 
 
 		 221 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  31.84 
 
 		 221 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  31.84 
 
 		 221 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  31.84 
 
 		 221 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  31.84 
 
 		 221 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  30.81 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  32.2 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  30.96 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  29.95 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  30.92 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  30.43 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.53 
 
 		 225 aa  91.7  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0053  multiple drug resistance protein MarC  28.23 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  30.05 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  30 
 
 		 215 aa  89.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2141  multiple drug resistance protein MarC  27.64 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0214276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  29.23 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  29.19 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  29.19 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  29.19 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  29.19 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.3 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  29.19 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.36 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  30.3 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  30.3 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  30.3 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  30.3 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.23 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  30.3 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.62 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  30.3 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68750  multiple drug resistance protein MarC  28.64 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  30.3 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  29.8 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5951  multiple drug resistance protein MarC  29.67 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  29.8 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  28.37 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.7 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  27.96 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.96 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  27.96 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  27.96 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  27.96 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  27.96 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  27.96 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  27.96 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.88 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  25.63 
 
 		 208 aa  85.5  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.44 
 
 		 212 aa  85.1  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.7 
 
 		 217 aa  85.1  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000442646  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  30.77 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>