More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0258 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 
212 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
212 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  90.05 
 
 
211 aa  387  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  81.25 
 
 
210 aa  341  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  80.77 
 
 
210 aa  335  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0372  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  78.1 
 
 
215 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  70.67 
 
 
206 aa  296  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  66.98 
 
 
213 aa  278  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  72.25 
 
 
217 aa  277  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  66.67 
 
 
239 aa  277  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  53.08 
 
 
207 aa  202  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50.24 
 
 
207 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3245  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  51.66 
 
 
207 aa  201  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  51.17 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  51.17 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  51.17 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  51.17 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  51.17 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  51.17 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  51.17 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  51.17 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  49.28 
 
 
206 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  48.82 
 
 
207 aa  194  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.8 
 
 
206 aa  194  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.76 
 
 
207 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  47.37 
 
 
206 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  47.37 
 
 
206 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  48.36 
 
 
206 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  47.37 
 
 
206 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.89 
 
 
206 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.83 
 
 
206 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.7 
 
 
206 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.93 
 
 
206 aa  184  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  51.01 
 
 
202 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  44.17 
 
 
216 aa  148  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.17 
 
 
218 aa  148  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  38.35 
 
 
210 aa  144  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  37.86 
 
 
210 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  37.86 
 
 
210 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  38.35 
 
 
207 aa  143  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  37.86 
 
 
210 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  37.86 
 
 
210 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  37.2 
 
 
212 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  38.35 
 
 
210 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  38.35 
 
 
210 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  38.35 
 
 
210 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  38.35 
 
 
210 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  37.38 
 
 
210 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  38.16 
 
 
213 aa  141  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  37.14 
 
 
207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  38.97 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.68 
 
 
213 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.96 
 
 
201 aa  137  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.96 
 
 
201 aa  136  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  38.94 
 
 
215 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  38.94 
 
 
215 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  37.5 
 
 
215 aa  135  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  38.94 
 
 
215 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  38.94 
 
 
215 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  38.94 
 
 
215 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  38.1 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  38.16 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  37.8 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  38.94 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.94 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  38.94 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  38.94 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  38.94 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  38.94 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  38.94 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  38.94 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  38.94 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 
217 aa  132  5e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  38.16 
 
 
214 aa  131  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  37.56 
 
 
214 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  37.56 
 
 
214 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  36.71 
 
 
214 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  36.71 
 
 
212 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  34.48 
 
 
208 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.36 
 
 
205 aa  125  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  37.2 
 
 
210 aa  124  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.25 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  36.18 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.72 
 
 
213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.19 
 
 
209 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.06 
 
 
212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  36.18 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.35 
 
 
213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.98 
 
 
207 aa  117  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.64 
 
 
207 aa  117  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  34.87 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.48 
 
 
212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.87 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.63 
 
 
217 aa  112  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.02 
 
 
209 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.55 
 
 
204 aa  111  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.83 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.89 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.22 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.9732  normal  0.188603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.43 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>