More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1407 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1407  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0713518  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  44.44 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  43.15 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3316  multiple antibiotic resistance protein  39.52 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.81 
 
 		 208 aa  145  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.61 
 
 		 212 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  38.83 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.02 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  37.88 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.52 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0155  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.85 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.3 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10401  hypothetical protein  36.22 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.71 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  32.84 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.72 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.65 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  24.75 
 
 		 211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  24.75 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  34.13 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.65 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.43 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.43 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.5 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29 
 
 		 204 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  31.68 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  31.68 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  31.68 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  30.2 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.85 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.86 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.96 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193827  hitchhiker  0.0000682503 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2046  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  24.76 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.86 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  27.78 
 
 		 217 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  29.7 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.7 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1532  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.92 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000919754  unclonable  2.03359e-19 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.73 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  29.9 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  29.29 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  31.19 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4013  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.46 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.648921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.5 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  29.85 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  31.19 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  31.37 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  28.86 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0272  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.77 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  30.33 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.92 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3711  multiple antibiotic resistance protein  32.83 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.372343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  27.88 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.78 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  32.04 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  31.37 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1791  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  24.77 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.32 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  32.66 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.71 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.02 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.04 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0372  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.57 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  25.64 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.57 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.08 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000442646  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.89 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  32.16 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  26.37 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  32.12 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  32.12 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  32.12 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  32.12 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  32.16 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  32.12 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  32.16 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  32.16 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.57 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  31.16 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.53 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.53 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  31.16 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  31.16 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  31.16 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.37 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1743  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.41 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565671  normal  0.375082 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6025  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.81 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0264079 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.01 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.27 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  31.22 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  31.61 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.61 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  27.86 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  31.61 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  31.61 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  31.61 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  31.61 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.9 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  31.61 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>