More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08146 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  100 
 
 		 204 aa  401  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2825  integral membrane protein, MarC family  50.73 
 
 		 207 aa  208  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  51.49 
 
 		 202 aa  205  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00158  multiple antibiotic transporter  49.51 
 
 		 208 aa  195  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3071  MCP methyltransferase, CheR-type  49.21 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.574672  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.73 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.99 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  34.18 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  36.27 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  36.87 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  34.87 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.87 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  36.27 
 
 		 197 aa  118  7e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  35.42 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.54 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0374  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.89 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.774303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.38 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.35 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  34.38 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.36 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.2 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.84 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  32.99 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.67 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.36 
 
 		 206 aa  112  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.82 
 
 		 209 aa  111  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.65 
 
 		 215 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2813  hypothetical protein  33.67 
 
 		 197 aa  111  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.864599  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.82 
 
 		 197 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.81 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.34 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.82 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.49 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.98 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1802  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.15 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0240208  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.1 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1147  hypothetical protein  31.34 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.938365  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.85 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0558  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.3 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  hitchhiker  0.000600217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.14 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0588  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.3 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.69 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000442646  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3673  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.3 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  34 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1763  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.84 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.619286  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  33.33 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0516  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.3 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0622801  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3442  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.96 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00112955  hitchhiker  0.00103877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1743  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.16 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565671  normal  0.375082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0491  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.3 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51349  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.8 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  31.79 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.34 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0955  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.63 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0106  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.8 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2516  MarC membrane protein  30.85 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.376397  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3517  hypothetical protein  30.85 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.836337  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3266  MarC membrane protein  30.85 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3519  MarC membrane protein  30.85 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0438  MarC membrane protein  30.85 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1297  MarC membrane protein  30.85 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3481  MarC membrane protein  30.85 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371296  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  32.84 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  29.8 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.19 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2645  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.46 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  30.65 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.65 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.65 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.65 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.65 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  31.79 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.39 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000587545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.65 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0514  multiple antibiotic resistance (MarC)- related protein, putative transporter  30.46 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  32.47 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.65 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  30.65 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.65 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.41 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.37 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0614  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.93 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  31.31 
 
 		 194 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2908  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein protein  35.44 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.275757  normal  0.0232741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.85 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.73 
 
 		 212 aa  101  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.73 
 
 		 212 aa  101  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0268  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.2 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0218  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.69 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3099  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.59 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.554479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  30.77 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.16 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.15 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3941  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.95 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00858561  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0693  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.34 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  30.77 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>