More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0043 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0043  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
196 aa  376  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31536  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2139  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  65.26 
 
 
197 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1083  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  59.04 
 
 
205 aa  229  2e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.175416  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0040  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  60.11 
 
 
206 aa  226  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0101018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0846  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.43 
 
 
192 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1185  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.83 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.86 
 
 
211 aa  91.3  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.57 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.79 
 
 
197 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.19 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  33.33 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.28 
 
 
207 aa  89  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  27.41 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  32.81 
 
 
197 aa  87.8  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  28 
 
 
197 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28 
 
 
197 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  28 
 
 
197 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  28 
 
 
197 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  28 
 
 
197 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  28 
 
 
197 aa  85.1  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  28 
 
 
197 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  28 
 
 
197 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  28 
 
 
197 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.77 
 
 
219 aa  84.7  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.55 
 
 
212 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  30.46 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  31.66 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0092  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.5 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.28 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.85 
 
 
210 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0188  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.11 
 
 
197 aa  82  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.73 
 
 
205 aa  82  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  29.15 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.15 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.93 
 
 
200 aa  82  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  31.11 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.77 
 
 
215 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.95 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00811054  hitchhiker  0.000115655 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.9 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.9 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.16 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0129  hypothetical protein  27.98 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0118  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.44 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2645  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.23 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0268  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.08 
 
 
197 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0487313  hitchhiker  0.00000474402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.95 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.88 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.39 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.05 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4231  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.93 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4152  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.98 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.46 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0309852  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.93 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.35 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.95 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.05 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0127  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.93 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0045  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.32 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4649  putative dITP- and XTP- hydrolase  27.55 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_002936  DET1449  MarC membrane protein  28.19 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000727679  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4111  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.23 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.779903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  32.99 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.93 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.99 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  29.56 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0140  putative dITP- and XTP- hydrolase  29.23 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  29.8 
 
 
209 aa  79  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.88 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.05 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.41 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3626  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.46 
 
 
198 aa  79  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  29.38 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2908  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein protein  34.04 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.275757  normal  0.0232741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.94 
 
 
201 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000587545  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  29.61 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  29.61 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  29.61 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  29.61 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  29.61 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  29.61 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  29.61 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  29.61 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.39 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.11 
 
 
203 aa  77.8  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8100  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.57 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.21 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0218  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.3 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1164  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.81 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0901375  normal  0.311138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.15 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2813  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.864599  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0954  integral membrane protein, MarC family  30.16 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.789644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.3 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3442  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.26 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00112955  hitchhiker  0.00103877 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3099  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.14 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.554479  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  24.88 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5060  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.44 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  31.75 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>