More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1228 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1228  membrane transporter, MarC family  100 
 
 		 203 aa  394  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1449  MarC membrane protein  93.56 
 
 		 203 aa  370  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000727679  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1251  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  96.06 
 
 		 203 aa  362  2e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000866197  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0846  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.65 
 
 		 192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0082  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.26 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.82 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  30.57 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  31.09 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.16 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.65 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.65 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.09 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  33.51 
 
 		 212 aa  96.3  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  32.8 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.8 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.8 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2056  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.94 
 
 		 193 aa  95.5  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  32.99 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.8 
 
 		 206 aa  94.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  29.65 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  29.65 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  29.65 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  29.65 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  29.65 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  29.65 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  29.65 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2139  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.41 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  29.65 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  27.27 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.79 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.05 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.27 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  31.96 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  31.96 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  31.96 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  31.96 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  31.96 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.21 
 
 		 197 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  30.21 
 
 		 197 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.21 
 
 		 197 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  30.21 
 
 		 197 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2433  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.61 
 
 		 191 aa  91.3  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.21 
 
 		 197 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.21 
 
 		 197 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.21 
 
 		 197 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5115  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.05 
 
 		 189 aa  91.3  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.21 
 
 		 197 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.65 
 
 		 206 aa  91.3  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.21 
 
 		 197 aa  91.3  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  30.93 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.93 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  30.93 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  30.93 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  30.93 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  30.93 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  30.93 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  30.93 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  30.93 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  30.93 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.22 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  29.29 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  30.93 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0561  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.77 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.143657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.29 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.8 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  30.93 
 
 		 214 aa  88.6  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  30.93 
 
 		 214 aa  88.6  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0996  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.85 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.643344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0042  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.24 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.26 
 
 		 207 aa  87.8  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  30.05 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.66 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0524  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.69 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.53 
 
 		 231 aa  85.9  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.3 
 
 		 218 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  29.9 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0040  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.93 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0101018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.58 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000587545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3746  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.28 
 
 		 197 aa  85.1  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000432224 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.7 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1185  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.78 
 
 		 213 aa  84.7  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.27 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.67 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  32.14 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4828  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.58 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.14 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3941  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.87 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00858561  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.79 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1083  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.53 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.175416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0092  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.98 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4152  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.46 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.47 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0140  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.94 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  31.69 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0110  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.78 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.186935 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002135  multiple antibiotic resistance protein marC  32.28 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.41 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.9732  normal  0.188603 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3626  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.63 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>