More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_5060 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_5060  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 		 197 aa  378  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.93 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.18 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.6 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  36.51 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.91 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  40.1 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.1 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  37.5 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.5 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.73 
 
 		 203 aa  117  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.97 
 
 		 207 aa  117  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.85 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.5 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.18 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.32 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.32 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  31.22 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.98 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.68 
 
 		 206 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.72 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  36.5 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.32 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.72 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.68 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  34.12 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1164  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.31 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0901375  normal  0.311138 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.18 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  32.66 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.83 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.76 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  31.4 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.23 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3711  multiple antibiotic resistance protein  34.5 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.372343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.09 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.2 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  28.78 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2046  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.18 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.23 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.5 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.58 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  30.88 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  35.75 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  35.18 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  34.33 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  37.44 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  34.33 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  34.33 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  34.33 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  34.33 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  34.33 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  34.33 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  34.33 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  37.44 
 
 		 209 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3245  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.2 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.8 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  34.9 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2908  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein protein  36.82 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.275757  normal  0.0232741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  33.33 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  34.43 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  33.82 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  37.7 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  34.43 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  32.35 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  32.37 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  32.37 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  31.88 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  31.88 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0705  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.06 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  31.4 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  29.27 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  32.39 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8100  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.89 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  31.71 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0450  multiple drug resistance protein MarC  36.08 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0439205  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.82 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0272  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.69 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  32.14 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  30.99 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.36 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  30.99 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  30.99 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  30.99 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.84 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.81 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.84 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.14 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  31.88 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  31.88 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  34.3 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2479  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.89 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  29.76 
 
 		 213 aa  101  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  32.2 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.72 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.78 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.729209 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.83 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  31.22 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.3 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>