More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2518 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2518  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 		 211 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.15 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.37 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  46.12 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  45.63 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1743  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.89 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565671  normal  0.375082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  42.79 
 
 		 205 aa  144  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  44.93 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.57 
 
 		 209 aa  143  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.79 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.51 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  42.79 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  42.79 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.42 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  49.51 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.43 
 
 		 208 aa  138  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.08 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0955  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.23 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2873  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.75 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0374  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.87 
 
 		 214 aa  134  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.774303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1802  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  42.51 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0240208  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.39 
 
 		 209 aa  131  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1763  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  42.11 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.619286  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.81 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3099  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.87 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.554479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0693  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.58 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.11 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.19 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.97 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1719  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.61 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.02 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.92 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.14 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000442646  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1553  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.34 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.460198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.15 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  35.75 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.65 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.3 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2476  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.58 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.16 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.55 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2825  integral membrane protein, MarC family  32.37 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  33.01 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1602  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.41 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0931799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.63 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.666037 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.32 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  34.47 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2079  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.05 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00616176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.62 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.62 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.61 
 
 		 205 aa  97.8  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0268  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.02 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  32.31 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.86 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  31.79 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  30.77 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  30.77 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.5 
 
 		 213 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  30.77 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  31.28 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  30.77 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  31.28 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  31.31 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  31.31 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  30.77 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  31.31 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  31.31 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  31.31 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.21 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.61 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.22 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.22 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  30.46 
 
 		 214 aa  95.1  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.1 
 
 		 201 aa  95.1  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  31.31 
 
 		 214 aa  95.1  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  29.65 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  30.77 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  31.28 
 
 		 212 aa  94.7  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  31.31 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.31 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  31.31 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  31.31 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  35.64 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00158  multiple antibiotic transporter  33.18 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  31.31 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  31.31 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  31.31 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  32.31 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.68 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  31.31 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  31.31 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  31.31 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.24 
 
 		 202 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  33.68 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.47 
 
 		 218 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  30.77 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  34.47 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>