44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4771 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  763    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  63.96 
 
 		 371 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  62.33 
 
 		 369 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  57.59 
 
 		 363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  53.31 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  50 
 
 		 372 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  51.28 
 
 		 366 aa  364  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  43.3 
 
 		 430 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  40.07 
 
 		 327 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  40.07 
 
 		 327 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  40.07 
 
 		 327 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  40.07 
 
 		 327 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  40.07 
 
 		 327 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  41.61 
 
 		 306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  37.9 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  37.9 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  37.58 
 
 		 327 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  37.58 
 
 		 327 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  37.58 
 
 		 327 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  38.78 
 
 		 408 aa  229  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  39.94 
 
 		 321 aa  209  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0023  hypothetical protein  34.67 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00775976  normal  0.0839132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  32.7 
 
 		 369 aa  116  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  31.9 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0139  hypothetical protein  35.64 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0837482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  24.48 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  27.6 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  23.89 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  25.26 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  23.32 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  21.11 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  24.54 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  22.26 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  26.13 
 
 		 299 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0552  hypothetical protein  26.04 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581187  decreased coverage  0.00305062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  27.22 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156236 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0308  ribonucleotide reductase  24.77 
 
 		 308 aa  49.7  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.436127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34070  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.56 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  19.21 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  24.9 
 
 		 308 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  32.43 
 
 		 419 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4508  hypothetical protein  25.79 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1906  hypothetical protein  27.82 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4131  ribonucleotide reductase  24.35 
 
 		 296 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>