36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3279 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  758    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  52.33 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  50 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  50.97 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  48.28 
 
 		 366 aa  353  4e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  50.61 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  48.5 
 
 		 363 aa  348  6e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  47.03 
 
 		 369 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  42.07 
 
 		 327 aa  278  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  42.39 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  41.88 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  41.88 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  41.88 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  41.88 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  41.88 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  41.75 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  41.75 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  41.42 
 
 		 327 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  42.03 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  41.1 
 
 		 408 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  40.97 
 
 		 321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  29.26 
 
 		 378 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  28.29 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0023  hypothetical protein  27.57 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00775976  normal  0.0839132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0139  hypothetical protein  31.17 
 
 		 374 aa  93.6  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0837482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  21.45 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0552  hypothetical protein  26.56 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581187  decreased coverage  0.00305062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  26.83 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  22.78 
 
 		 299 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  26.09 
 
 		 301 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4508  hypothetical protein  22.56 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1906  hypothetical protein  29.58 
 
 		 296 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  26.74 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  28.19 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  23.83 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  30.2 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>