33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3229 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  832    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  41.1 
 
 		 372 aa  236  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  39.31 
 
 		 371 aa  236  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  38.11 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  38.78 
 
 		 370 aa  229  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  37.82 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  36.31 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  34.97 
 
 		 363 aa  207  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  34.67 
 
 		 430 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  37.42 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  32.08 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  31.45 
 
 		 327 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  30.82 
 
 		 327 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  30.82 
 
 		 327 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  30.82 
 
 		 327 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  31.23 
 
 		 327 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  31.23 
 
 		 327 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  31.23 
 
 		 327 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  31.23 
 
 		 327 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  31.23 
 
 		 327 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  31.54 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  29.6 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  34.54 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0023  hypothetical protein  32.49 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00775976  normal  0.0839132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0139  hypothetical protein  27.67 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0837482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0552  hypothetical protein  23.5 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581187  decreased coverage  0.00305062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2779  hypothetical protein  28.48 
 
 		 302 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294116  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4508  hypothetical protein  25.77 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2642  hypothetical protein  23.77 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.233765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  30.47 
 
 		 353 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  24.11 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  24.11 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  24.11 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>