42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3501 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  865    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  51.85 
 
 
372 aa  398  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  43.21 
 
 
370 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  46.43 
 
 
360 aa  300  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  44.12 
 
 
369 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  43.55 
 
 
371 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  41.57 
 
 
363 aa  290  5.0000000000000004e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  39.66 
 
 
366 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  40.84 
 
 
327 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  40.84 
 
 
327 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  40.84 
 
 
327 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  40.84 
 
 
327 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  40.84 
 
 
327 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  41.61 
 
 
306 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  39.94 
 
 
327 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  39.94 
 
 
327 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  39.94 
 
 
327 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  39.94 
 
 
327 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  39.63 
 
 
327 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  36.36 
 
 
321 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  34.67 
 
 
408 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  30.81 
 
 
378 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  28.22 
 
 
369 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  29.1 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0023  hypothetical protein  26.74 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00775976  normal  0.0839132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0139  hypothetical protein  23.81 
 
 
374 aa  67  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0837482  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  25 
 
 
323 aa  63.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  21.99 
 
 
301 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  25 
 
 
299 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  23.67 
 
 
299 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  21.23 
 
 
301 aa  56.6  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  26.13 
 
 
310 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  26.06 
 
 
303 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0552  hypothetical protein  27.98 
 
 
390 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581187  decreased coverage  0.00305062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  24.37 
 
 
308 aa  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2779  hypothetical protein  35.38 
 
 
302 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  24.75 
 
 
308 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  22.22 
 
 
300 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4508  hypothetical protein  27.36 
 
 
422 aa  46.6  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  26.59 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1023  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  21.15 
 
 
297 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  30.23 
 
 
419 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>