71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0537 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0537  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  699    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5222  ribonucleotide reductase  39.15 
 
 		 306 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.283701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2539  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  32.52 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4450  ribonucleotide reductase  28.96 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5269  Sterol-binding domain protein  30.51 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5125  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  30.92 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653993  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0745  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  29.58 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4131  ribonucleotide reductase  28.99 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0835  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit 2  29.94 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1317  hypothetical protein  30.08 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4876  ribonucleoside-diphosphate reductase  27.95 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4192  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  29.81 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3780  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  25.26 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834466  normal  0.123752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5565  Ribonucleoside-diphosphate reductase  26.69 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1023  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  24.55 
 
 		 297 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1973  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  24.14 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0182358  normal  0.423749 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0133  ribonucleotide reductase  25.68 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3618  hypothetical protein  28.9 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6268  Ribonucleoside-diphosphate reductase  25.87 
 
 		 331 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0689361 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1737  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  24.69 
 
 		 401 aa  52.8  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0435  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  24.69 
 
 		 401 aa  52.8  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4387  ribonucleoside-diphosphate reductase  26.84 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  27.22 
 
 		 370 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4495  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  25.85 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265402  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3466  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  26.37 
 
 		 312 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1227  Ribonucleoside-diphosphate reductase  22.22 
 
 		 319 aa  50.1  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.569961  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0308  ribonucleotide reductase  23.81 
 
 		 308 aa  50.1  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.436127  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10235  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  26.15 
 
 		 314 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0207  Ribonucleoside-diphosphate reductase  22.22 
 
 		 339 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3061  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  26.67 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0486653 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21930  ribonucleotide reductase, beta subunit  23.5 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.113756  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2622  Ribonucleoside-diphosphate reductase  24.28 
 
 		 353 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00719466  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3412  Ribonucleotide reductase beta subunit-like protein  23.88 
 
 		 309 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2459  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  19.75 
 
 		 423 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.955756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  30.47 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  27.22 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  27.54 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2041  Ribonucleoside-diphosphate reductase  26.05 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2656  Ribonucleoside-diphosphate reductase  21.05 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.840275  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0215  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.21 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0959296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  27.54 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3152  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  19.76 
 
 		 416 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1725  ribonucleoside-diphosphate reductase  25.74 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33300  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  20.99 
 
 		 416 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2702  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.89 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  30.2 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  26.47 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49470  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  19.77 
 
 		 415 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0051562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4225  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  19.77 
 
 		 415 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2940  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.83 
 
 		 394 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100724  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2636  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.83 
 
 		 402 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4674  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.62 
 
 		 328 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3046  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.83 
 
 		 402 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2804  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.83 
 
 		 400 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  0.329365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3721  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  19.75 
 
 		 415 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3518  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.93 
 
 		 386 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  25.81 
 
 		 366 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1661  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit  19.75 
 
 		 415 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3087  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.83 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4295  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  20.96 
 
 		 416 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1637  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  20.36 
 
 		 403 aa  43.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1739  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.16 
 
 		 367 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4280  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.86 
 
 		 312 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4214  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  23.86 
 
 		 312 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.885142  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1191  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  20.96 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.511312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1209  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  20.96 
 
 		 415 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1739  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.16 
 
 		 367 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4238  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  20.96 
 
 		 416 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1177  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  20.96 
 
 		 416 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.726447  normal  0.0669106 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0205  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  22.83 
 
 		 394 aa  42.7  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000182543  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1009  Ribonucleoside-diphosphate reductase  23.08 
 
 		 398 aa  42.7  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.746585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>